生化處理是處理氨氮超標的常用方法。管理得當，對氨氮，甚至COD和總磷都會有很好的去除效果。但生化處理存在很多限制因素，如場地、溫度、進水濃度、碳氮比等，都會在壹定程度上影響有機物對氨氮的分解，導致出水效果不理想。壹般在生化處理後與化學藥劑配合使用，以達到更高的去除效率。
(1)生化處理:
常用的脫氮工藝就是我們常見的AO工藝。原理:氨(NH3)被亞硝化細菌氧化成亞硝酸鹽，亞硝酸鹽被硝化細菌氧化成硝酸，稱為硝化作用。硝化作用需要氧氣，當水中溶解氧濃度低於1 ~ 2 mg/L時，硝化速度明顯降低。在水中沒有溶解氧的情況下，當反硝化菌能將硝酸還原為亞硝酸、亞硝酸、羥胺或氮氣時，這個過程稱為硝酸還原，當形成的氣態氮作為代謝產物釋放出來並從系統中損失時，稱為反硝化作用。
(2)化學處理劑:
Pac和PAM可以處理SS造成的氨氮超標(實際應用不大，可以降低的氨氮值不多)
臭氧可以在工藝結束時提前去除氨氮(成本高，能耗大，難以控制)
投加氨氮去除劑JN-1將氨氮氧化成氮氣的方法是目前汙水處理行業廣泛采用的方法。添加氨氮去除劑可直接裝入原工藝的沈澱池中，藥劑反應時間約為5-6min，無需增加額外的設備和工藝，大大降低了成本。
與去除廢水中氨氮的方法相比，該氨氮去除劑操作簡便，用量少，氨氮去除率達到96%以上。成本可控，處理結果穩定，無二次汙染。同時具有脫色和調節pH值的作用。