1.數據主要來源於過去發生的事情。
經濟業務的積累。兩種方法所依據的數據是會計數據，會計數據是企業過去經濟活動的結果和總結，只對控制現在和預測未來的財務分析有參考價值，以供企業作出壹些決策。
2.數據可能沒有反映真實情況。
財務報表是根據會計準則和規範編制的，但不壹定能完全反映企業的客觀實際。基於這些數據的分析，很容易產生“真分析出來的虛假報表”或者含有人為因素，報表反映的是管理者的意願。不能真實分析企業的財務狀況和經營成果。
3.同類經濟業務的會計數據存在差異。對於同壹種經濟業務，不同的企業可以選擇不同的核算程序，企業前期和後期不同的操作人員有不同的計算方法，所以數據有不同的解讀，數據本身也有壹定的差異，不能“死”分析。
4.數據在信息傳遞中存在缺陷。會計報表所反映的數據和會計信息是有限的，信息的表達內容必然是規模化的，這必然會影響分析結果的準確性。
5.這兩種分析方法都有各自的局限性。兩種分析方法只能提供有限的信息，企業的業務形成的數據復雜，分析只能回答“是什麽”而不能回答“為什麽”。僅憑分析的結果，很難準確判斷壹個企業的整體經營情況。
在了解了比較分析和比率分析的這些局限性後，我們在使用這兩種方法時，應該註意它們的不利影響，以提高財務分析的質量和效果。