土木工程專業
國家壹流本科專業建設點，國家特色專業，福建省壹流重點學科。
土木工程學院，前身為土木工程系，創建於1958。土木工程專業是國家壹流本科專業建設點、國家特色專業、教育部首批培養卓越工程師試點專業、福建省重點本科高校服務業特色專業。
土木工程是福建省壹級重點學科，福建特色重點學科。結構工程是國家重點學科。據編輯Maigoo介紹，學院擁有土木工程壹級學科博士點和博士後科研流動站，土木工程壹級學科碩士學位。
擁有土木工程防震減災信息化國家和地方工程研究中心、福建大學可持續創新橋梁工程研究中心、土木工程新技術與防災減災國家重點學科建設項目“211工程”。
機械設計制造及其自動化專業
國家壹級本科專業建設點和國家特色專業
福州大學機械工程及其自動化學院是福州大學成立之初的五個院系之壹。其中機械工程學科為211國家重點學科，福建省雙壹流“高峰學科”。
“機械設計制造及其自動化”專業是機械工程專業主幹專業，福州市熱門王牌專業，教育部多項改革試點專業，國家特色專業，全國首批壹流本科專業。經過60多年的建設，形成了覆蓋本科、碩士、博士、博士後的完整專業人才培養體系。
擁有壹級學科碩士學位授權點、壹級學科博士學位授權點和博士後科研流動站，壹級學科學位授權點下設多個二級學科學位授權點。