我們可以說，儒學與科學的關系就是善與真的關系。它包括真善美三個方面。但總的來說，儒家追求善與仁的哲學也是其核心。在科學中，尋求真理至關重要。從這個角度來說，儒家思想和科學不是相互排斥的，而是相互兼容、相互促進的。儒家也追求科學真理。
在發現善的問題上，儒家重視言傳身教的作用，但也強調從發現真理的角度去發現善是有方法的。儒家思想的核心是敬德，但同時又認為要向宗教學習。從某種意義上說，宗教是尊德的稱謂。儒家從混沌中看到了善是道德的基礎，但並不否定和忽視自然界萬物的知識，而是將自然界萬物的知識融入道德，發展成為認識善的途徑。
所以儒家不妨礙真理，也不妨礙科學。只是在儒家看來，必須依靠自然科學來尋找真理。因為儒家需要科學。比如我們教人的時候，需要天文歷法，農業，醫學，地理等等。儒家思想也有助於現代科學家的研究。愛因斯坦認為，現代科學家要有正確的真理價值觀，崇尚真理的價值觀的建立離不開人文素質的支撐，即來自儒家思想。