水墨動畫的制作需要渲染上色，制作過程非常復雜，時間和人力的消耗驚人。也正是傳統水墨動畫高投入低回報的局限性，以及藝術價值與商業價值相分離的獨特屬性，使得水墨動畫面臨著難以為繼的尷尬。當今，推動和發展中華文化在中國與世界多元文化的融合發展，是海外華人的光榮而艱巨的任務，也是華人的神聖使命。
90年代，美國電影廠迎來體制改革。原來由政府出資，取消了國家價格收購的特殊待遇。
也就是說，電影制片廠斷奶了。可惜電影制片廠並沒有在商業大潮中變得越來越勇敢。現任上海動畫電影制片廠副廠長的朱玉萍說，這是壹個投資回報的問題。歸根結底，剪紙，水墨畫等。都是手工，成本很高。水墨動畫的成本是普通技術的三倍，但電視臺的采購價格是壹樣的。為了不讓技術流失，只能做壹些美術短片和廣告。但即便如此，也很難收回成本。
同時，國外動畫片的湧入，動搖了上海美影廠在中國的獨特地位。同時，廣東成立了大量的動漫公司，主要是給國外廠商加工。