官辦手工業是指由政府直接控制的手工業制造部門，大概包括工業部、總醫院、大部分留守部門和吳蓓廟。工業部主管全國的建設，將用於院內寶物的制造。他們大多留下來負責建造和修復皇家宮殿和貴族住宅，並在吳蓓寺制造武器和軍用物資。此外，王侯、皇後、貴族往往都有自己的官方手制機構。各級地方政府也有不同類型和規模的手工業制造機構。由於政府的特權，元代官方手工業集中了大量的優秀工匠，資金雄厚，原料廉價，所以生產的手工業產品不僅數量巨大，而且質量上乘。著名的工業有瓷器、毛毯、絲織、武器、采礦和冶金、制鹽等。
元代的私人手工業也在前壹代的基礎上空前發展。這些私人手工業壹般采用家庭作坊的形式，生產的產品多集中在納稅用的絲織品和生活必需的棉織品和亞麻布上。隨著商品經濟的初步發展，元代手工作坊中出現了雇傭勞動，這種現象相當普遍。這說明元代的私人手工業非常發達。元代私人手工業的著名行業有棉紡織、絲織、制瓷和礦冶。