壁掛式馬桶和落地式馬桶最大的區別在於安裝方式。壁掛式馬桶掛在底部和墻上，水箱與桶體分離，水箱藏在墻上。壁掛式衛生間也細分為幾種風格，根據排水方式分為墻排和地板排。水箱分為低配型和高配型，低配版和高配版分別為壁掛式和自立式。
壁掛式馬桶的水箱隱藏在墻內，沖水時噪音低。水箱位置越高沖量越大，馬桶不易堵塞，解決了馬桶布局受限的問題。壁掛式馬桶最大的優點就是沒有衛生死角，掛在墻上更容易清洗。傳統的馬桶與地面相連，容易藏汙納垢，而且往往很難清洗。壁掛式馬桶水箱隱藏在墻壁上，使外觀更加簡潔美觀。相對於落地馬桶，壁掛式馬桶水箱需要安裝在墻上，所以需要提前規劃好水路和框架。
另外，壁掛式衛生間在安裝過程中使用了衛生間移位器，需要專業師傅進行施工，否則很可能會影響衛生間的承載力，甚至漏水。壁掛式馬桶水箱和坐便器需要分開購買，水箱的質量要求很高，所以價格也比較貴。壹般來說，它們比普通廁所大壹倍。另外，壁掛式衛生間的墻體安裝比較困難，需要嵌入墻體。耗材和建設成本都會增加很多。