比較突出的有:《福建傳統音樂》獲中國高校人文社會科學優秀成果壹等獎；琉球帝制音樂與中國音樂，斷裂與失衡——從中西視角分析20世紀西方“新音樂”創新的局限性，《中國傳統音樂結構》獲全國高校人文社會科學優秀成果二等獎。《高師音樂教學綜合改革》、《民族音樂學及其教育碩士專業課程教材建設》、《中國傳統音樂理論博士、碩士專業教材建設》獲國家優秀教學成果獎二等獎。“中國音樂文化的國際傳播與推廣”獲教育部2011年度哲學社會科學研究重點項目；《世界民樂》獲國家精品課程；《中國傳統音樂概論》、《歐洲音樂文化史隨筆——中國人眼中的歐洲音樂》、《反思與探索——對20世紀西方“新音樂”若幹問題的思考》、《中國民樂》等9部作品分別獲得第壹、二、四、五、六、七、八、九屆福建省社科獎。民樂三重奏《祭榕城》獲第五屆福建省文藝百花獎壹等獎。音樂學博士生李梅博士和郭曉麗博士的博士論文分別於2002年和2011年被評為“中國百篇優秀博士論文”。在2005年和2009年的“全國大學生美展”中，音樂學院連續獲得專業組壹等獎。2006年，音樂學院合唱團參加第四屆世界合唱節，獲得金獎和銀獎。2008年，音樂學院合唱團在中國音協主辦的“唱響西海岸——中國福州首屆海峽兩岸合唱節”中榮獲金茉莉獎；2010音樂學院合唱團在第十四屆CCTV全國青年歌手電視大獎賽中分別獲得團體賽和單人合唱比賽優秀獎。2012“第三屆全國大學生美展”音樂學院獲專業組壹等獎1。