植物病害前期的接種源包括細菌越冬和越冬的場所、中間寄主、帶菌土壤、帶菌種子等繁殖材料和田間病害中心。在接種源施用農藥，消除或減少病原細菌的傳染源，是保護植物免受傷害的重要策略。利用這種策略防治植物病害的效果與接種源的位置、數量和傳播途徑有關。如果只是通過苗木等繁殖材料傳播的病害和通過病心傳播的病害，在相對容易控制的條件下，通過用化學藥劑處理苗木或在病心使用具有根除作用的殺菌劑，可以經濟有效地防止病害的流行危害。例如使用二硫氰基甲烷、福美雙等。對於種子處理，不僅成本低，而且效果可高達95%。長期采用這種消除傳染源的策略，已經完全控制了半個世紀前嚴重流行的壹些禾谷類作物的種傳病害。而通過土壤、水、病殘人群、氣流或各種途徑傳播的疾病，由於病原體傳染源的復雜性和數量巨大，將很難被徹底消滅，而且傳染源藥物處理後殘留的病原體足以造成流行性危害，難以達到理想的效果。如小麥紋枯病、黑星病、白粉病、銹病、稻瘟病、紋枯病、細菌性葉枯病、棉花枯萎病、黃萎病、蔬菜細菌性青枯病、霜黴病、蘋果和梨黑星病等。目前，大多數重要的土傳和氣傳疾病都無法通過消除傳染源得到有效控制。
2.處理可能被藥物感染的植物或農產品的表面。
在寄主植物被病原菌侵染之前施用農藥，從而殺死病原菌，阻止真菌的孢子萌發，或者幹擾病原菌與寄主的相互作用，阻止病原菌的侵染，使植物得到化學保護。這是預防和控制貯藏期間通過空氣傳播的莖、葉和果實的大多數疾病的最有效策略。壹般通過噴、浸等方式將藥劑均勻地施於寄主植物或器官上，使植物表面形成壹層藥膜，從而殺死病菌孢子或防止病菌侵染。非內吸性殺菌劑的使用傳統的殺菌劑如硫磺、堿式硫酸銅、代森錳鋅、福美雙，現代的選擇性殺菌劑如異菌脲、醚菌酯，內吸性殺菌劑三環唑，只有在病原菌侵染前施用，才能防治植物病害。用三唑醇、苯醚甲環唑等內吸性殺菌劑處理種子，可防止苗期土傳猝倒病和空氣傳播的白粉病、銹病。
3.在病原體感染前，應用化學物質幹擾病原體的致病性或誘導宿主產生抗病性
黑色素抑制劑三環唑抑制稻瘟病菌附著胞內黑色素的生物合成，使附著胞失去入侵寄主的能力，從而保護植物。活性酯是壹種植物防禦激活劑，可通過誘導寄主獲得抗病性來防治真菌、細菌和病毒等多種植物病害。因為誘導寄主抗性需要壹定時間，所以必須進行保護性施藥。