古希臘也有壹些對煉金術感興趣的學者，他們不是為了營利而卷起袖子在小作坊裏煉金，好奇心讓他們對各種金屬合金之間的轉變興奮不已，他們相信金屬可以“嬗變”，思索著物質變化的規律，留下了壹些理論。
古希臘衰落讓希臘文化沈寂下來，其中包括對金屬嬗變的探索，但民間工匠們制作贗金的活動仍在悄悄地繼續著。中世紀晚期，學者們從阿拉伯文獻中重新發現古希臘文明，此時阿拉伯人也把自己發展了的煉金術加上中國煉丹術帶到了歐洲。於是，古希臘煉金術、阿拉伯煉金術以及中國煉丹術，五光十色地進入歐洲文藝復興時期學者們的視野。
文藝復興時期的歐洲學者思維敏銳、敢於批判，對重見天日的古希臘璀璨文明充滿驚喜但並不教條，對來自其他地區的文明元素也欣然思索。這個學者群體還有壹個特點就是大多為衣食無憂之士，很少以營利為科學活動目的。到了文藝復興晚期，很多壹流學者走出“象牙塔”，向工匠們學習工藝（包括煉金工藝），然後制作新工具、建立實驗室。此時此刻，現代實驗科學已經初現雛形。
首先提倡自然探索的實驗方法，而不能僅僅依靠邏輯演繹的是英國自然哲學家羅傑·培根（Roger Bacon，1214～1293），因此被科學史學者們視為現代科學的奠基人。事實上，培根熱衷煉金術，其實驗方法正是來自壹直被高貴的自然哲學家們看不起的煉金士們。
而從傳統煉金術破繭而出化學理論的第壹位現代化學家是英國人羅伯特·波義耳（Robert Boyle，1627～1691），他出版於1661年的代表作《懷疑派化學家》（The Sceptical Chemist），是現代實驗科學的裏程碑。在這部書中，他用對話的形式，既批判了古希臘壹些沒有根據的理論（例如“四元素說”），也提出現代化學研究如何從“煉金”和“煉丹”的迷思和神秘主義中走出。他闡述了壹套嚴謹的科學研究方法，認為壹切理論必須被實驗證明才可能確立其“正確性”。波義耳之後，歐洲古典煉金士逐漸黯然退出歷史舞臺，現代化學家閃亮登場。