明治政府廢除了封建身份制度和武士特權,武士階級的地位受到挑戰。在明治政府成立之前,日本武士階層在日本的地位非常高。他們不僅可以在外出時佩戴刀具,而且每個月不用工作也能獲得非常高的收入。但明治政府成立後,這壹切都改變了,武士集團成為重點改革對象,廢除了封建身份制度和武士特權,包括武士階級的統治地位、封建財產權、壟斷軍權、射殺平民的權利。所以武士階層的地位受到了極大的挑戰,這也是日本武士階層衰落的開始。
明治政府發行了“陸金債券”,切斷了武士階層的經濟來源。在廢除身份制度和武士特權後不久,日本明治政府發行了“金券”,將武士階層的工資變成了公債,這意味著武士階層徹底失去了經濟來源,日本武士只能被迫轉行,以至於“金券”公布後,很多日本武士轉行經商。
日本明治政府大力發展資本主義,提出了“富裕強兵”的口號。為了增強國力,日本明治政府開始了全面向西方學習的浪潮,日本的很多歷史文化傳統都被拋棄了,武士階層也是如此。日本明治政府鼓勵資本家,尤其是與政府關系密切的資本家。明治政府進壹步提出了富國強兵的口號,並建立了壹支忠於天皇的軍隊。到目前為止,日本武士階層在軍隊中的最大作用也被禁止了。
1876年,明治政府頒布了廢刀令,引發了武士階層的叛亂,最終武士階層被明治政府消滅。在廢除劍令和壹系列針對武士階級的改革出現後,武士階級對明治政府發動了叛亂。雖然武士階級憑借其豐富的戰鬥經驗在壹開始就取得了優勢,但是在明治政府龐大的軍隊面前還是敗下陣來,日本武士階級慘遭屠戮,這也意味著屬於日本武士階級的時代徹底終結。
雖然日本武士階層在明治政府的壹系列改革下逐漸衰落,但日本武士精神壹直流傳下來,影響了壹代又壹代日本人,尤其是日本軍人。明治政府建立的軍隊信奉永不投降理論,誓死效忠天皇,精神力量極高。