在整個育苗期間，水育苗是壹種以淹水管理為主的育苗方式，利用水層保暖，起到壹定的防寒和防止苗內雜草的作用，而且拔苗容易，傷苗少，有防鹽保苗的作用。但長期淹水，土壤中氧氣不足，秧苗容易徒長，秧苗素質差，是我國稻區采用的傳統方法，目前很少使用。
壹般應註意種子質量、種子處理、播種質量、最佳播期、播種量(密度)、水稻秧苗肥水條件、土壤通透性、水稻秧苗管理和植物生長調節劑的應用。好的種子質量意味著種子必須具有很強的生存能力和很強的發芽勢，這樣的種子才能保證良好的種子基礎。經過適當的處理(如烘幹種子)，可以提高優質種子的發芽率和成苗率。
2.濕法育苗方法
濕育秧是介於水育秧和旱育秧之間的壹種育秧方式。這種育苗方法容易調節土壤中水和氣的矛盾，具有播種後出苗快而有序，不易發生生理猝倒的優點，有利於促進出苗生根，防止爛芽死亡，也可以通過水分管理促進和控制幼苗的生長。代替水育苗成為壹種基本的育苗方法。
比較常用的方法是地膜濕保溫育苗法。在濕式育苗的基礎上，播種後在隔室表面覆蓋壹層薄膜，多為低拱覆蓋。這種育苗方式有利於保溫、保濕、增溫，可及時早播，防止芽腐、苗腐，提高成苗率。早春播種是非常必要的，可以防止低溫和冷害。
3.幹式育苗方法
在整個育苗過程中，旱育秧只保持土壤濕潤，不保持水層。肥床(溫室)細土塑料盤、開合膜旱育秧等常用旱育秧方式，已成為寒地及雙季早稻壯苗、抗寒、抗旱、節水的重要育秧方式。
在肥沃疏松的苗床上，用細土法在肥床上用塑料托盤旱育秧苗，用塑料軟盤或紙筒旱育秧苗。該育苗方法的播種期不受水源限制，在旱秧田育苗操作方便；適用於大、中、小苗的培育。與塑料托盤相比，延長了秧齡，不串根，有利於高產品種的搭配和應用範圍的擴大。此外，該方法便於統壹供種、集中規模育種和商品苗供應。塑盤旱育秧是適合機械拋秧的最佳育秧形式，前景廣闊。
4.兩段育苗法
兩段式育苗是將整個育苗過程分為兩個階段。第壹階段是用密播幹育秧或濕育秧的方法培育3-4片葉的小苗；第二階段是送秧階段，將小苗按壹定密度送到有土或無土的送秧田，培育成多蘗大壯苗後移栽到田間。
這是壹種適合晚栽多茬苗的育苗技術。它的優點是成苗率高，耗種量低，早期發育強，可調節留茬矛盾。特別適用於麥茬中稻晚種、晚稻雙季和雜交水稻制種生育期長的情況。兩段育苗可以解決早播晚栽的矛盾，將抽穗期提前，避免開花期高溫或灌漿期低溫等不利影響。
5、塑料軟盤育苗方法
這種方法是由溫室育苗演變而來的壹種育苗方法，可以提高苗木比例，降低育苗成本，便於管理，苗木質量好，苗期不易生病。培育出來的秧苗可以用手栽，更有利於拋秧。
軟盤常用鈣塑軟盤育苗，長58厘米，寬28厘米，深2.6 ~ 2.8厘米。它們被放在田裏的床面上，裝滿營養土，澆水和播種。人工移栽稀播，每盤70 ~ 80克；機插密植為每盤100g，其他操作同開閉式旱育秧。水稻是在地裏種植的。