按鍵數分類 鼠標可以分為傳統雙鍵鼠、三鍵鼠和新型的多鍵鼠標。根據最早微軟的要求定義的鼠標只需要左右兩個鍵，早期玩電腦的朋友還應該記得鼠標右鍵在Windows 3.X中應用是十分有限的，直至到了WIN95操作系統出來以後右鍵的應用才有所增加。雙鍵鼠標結構簡單，應用廣泛,壹般無需驅動程序就可以在WIN9X下正常運作。三鍵鼠標是IBM在兩鍵鼠的基礎上進壹步定義而成的，又被稱為PC Mouse，與兩鍵鼠相比,三鍵鼠上多了個中鍵，使用中鍵在某些特殊程序中往往能起到事倍功半的作用，例如在Auto CAD軟件中就可以利用中鍵快速啟動常用命令,使工作效率成倍增加。早期的三鍵鼠標壹般都有壹個微型撥動開關，用作於切換兩鍵與三鍵兩種不同工作模式。為了與現有的操作系統兼容並發揮中鍵的作用，很多產品都配備自己的第三方驅動程序，將中鍵在WINDOWS系統中設置成某壹常用功能的快捷鍵。多鍵鼠標是在微軟發布Microsoft智能鼠標（IntelliMouse）之後,鼠標發展的新領域 ——“多功能應用”而產生的新壹代多功能鼠標。微軟智能鼠標帶有滾輪,使得上下翻頁變得極大的方便，在OFFICE軟件中可實現多種特殊功能，隨著應用的增加，之後其他廠商生產的新型鼠標除了有滾輪，還增加了拇指鍵等快捷按鍵，進壹步簡化了操作程序。多鍵多功能鼠標今後也將是鼠標未來發展的目標與方向。
按接口分類 鼠標可以分為COM、PS/2、USB三類(，傳統的鼠標是COM口連接的,它占用了壹個串行通訊口。由於豐富的外設不斷湧出和主板頻繁的的升級,人們逐漸開始使用PS/2鼠標，把本來為數不多的串行通訊口讓給其他外設使用，因此COM鼠標在市場上已成強弩之末。PS/2鼠標是目前市場上的主流產品，作為替代COM鼠標的接班人，目前市場份額已經相當的大，而且種類繁多，造型多樣。俗話說兔子尾巴長不了，PS/2這些老鼠看樣子也難以幸免。隨著USB接口的興起，預計今後USB接口鼠標將會成為市場新的賣點，不甘落後的廠家近日紛紛推出了各自的USB接口鼠標，雖造型手感並不怎麽樣，但也給相對沈穩的鼠標市場註入了壹劑興奮劑。個人認為,USB鼠標只不過是廠家為了增加產品的新賣點而采用的壹種手段，就目前測試數據來看,USB鼠標對普通鼠的性能提高相當甚微，因此在此還不予推薦。
按內部構造分類 這是鼠標分類最常用的壹種方式，可以分為機械式、光機式和光電式三大類。
機械式鼠標的結構最為簡單，由鼠標底部的膠質小球帶動X方向滾軸和Y方向滾軸，在滾軸的末端有譯碼輪，譯碼輪附有金屬導電片與電刷直接接觸。鼠標的移動帶動小球的滾動,再通過摩擦作用使兩個滾軸帶動譯碼輪旋轉，接觸譯碼輪的電刷隨即產生與二維空間位移相關的脈沖信號。由於電刷直接接觸譯碼輪和鼠標小球與桌面直接摩擦,所以精度有限，電刷和譯碼輪的磨損也較為厲害，直接影響機械鼠標的壽命。因此，機械式鼠標已基本淘汰而同樣價廉的光機鼠取而代之。
所謂光機鼠標,顧名思義就是壹種光電和機械相結合的鼠標，是目前市場上最常見的壹種鼠標。光機鼠在機械鼠標的基礎上將磨損最厲害的接觸式電刷和譯碼輪改進成為非接觸式的LED對射光路元件（主要是由壹個發光二極管和壹個光柵輪）,在轉動時可以間隔的通過光束來產生脈沖信號。由於采用的是非接觸部件使磨損率下降，從而大大地提高了鼠標的壽命，也能在壹定範圍內提高鼠標的精度。光機鼠的外形與機械鼠標沒有區別，不打開鼠標的外殼很難分辨。出於這個原因，雖然市面上絕大部分的鼠標都采用了光機結構，但習慣上人們還稱其為機械式鼠標。羅技旋貂就是壹款光機鼠標。