日本是個漫畫大國。日本漫畫業從12世紀就開始發展，可以說是世界上最早的。平安時代的《鳥獸人物戯畫》（鳥獣戯畫）被認為是日本最古老的漫畫作品。1862年，漫畫雜誌《Japan punch》（ジャパン?パンチ）在橫濱外國人居留地發行。1877年代表明治時代的漫畫雜誌《團團珍聞》創刊。日本漫畫家北澤樂天於1905年創立《東京パック》，對日本諷刺漫畫的發展貢獻很大。樂天從1928年開始在《時事漫畫》連載的《とんだはね子》是日本最初的以少女作為主人公的連載漫畫，是少女漫畫的先驅作品。1915年，日本漫畫家岡本壹平創立漫畫家團體東京漫畫會（也就是以後的日本漫畫會）。第二次世界大戰時期由於日本參戰，加上情報局的法規和用紙不足等緣故，日本的漫畫產業陷於衰退狀態。在第二次世界大戰後，日本漫畫界再次恢復了生氣。1954年，月刊少女漫畫雜誌《Nakayoshi》創刊。1959年，最初的周刊漫畫雜誌《周刊少年Sunday》和《周刊少年Magazine》創刊。1968年《周刊少年Jump》創刊。戰後初期影響了現代日本漫畫歷史的代表作品是手冢治蟲的《鐵臂阿童木》。1950年代以後越來越多日本漫畫家受到手冢治蟲作品的啟發。1960年代，石森章太郎、赤冢不二夫和藤子不二雄的作品大受歡迎。隨著電視突飛猛進的發展，頗受歡迎的漫畫開始被搬上銀幕，日本開始了動畫時代。1990年代後，漫畫的類型進壹步擴大，漫畫雜誌數量迅速增長，網絡漫畫等文化也應運而生。有觀點認為日本漫畫發展始於戰後同盟國軍事占領日本時期，這種觀點強調日本漫畫受美國文化的影響很大；其中包括日占時期美國大兵帶到日本的漫畫及美國電視、電影和卡通片（特別是迪斯尼）。但是壹些作家強調日本文化的延續和美學傳統是日本漫畫歷史的關鍵，他們包括Frederik L. Schodt Kinko Ito 和Adam L. Kern。
現代日本漫畫的發展階段： 第二次世界大戰後的半個多世紀以來，漫畫在日本的社會地位及人們對它的認識在不斷變化。手冢治蟲曾把日本現代漫畫的發展歸分為六個階段：
第壹階段（“二戰”後的第壹個十年）：“玩具時代”，漫畫只是供孩子娛樂的道具。
第二階段：“清楚時代”，漫畫被視為低俗、淺薄的讀物。
第三階段：“點心時代”，父母和教師勉強允許孩子在不妨礙學習的前提下看壹點漫畫。
第四階段：“主食時代”，1963年TV動畫《鐵臂阿童木》在電視上連續放映，許多家庭中的大人和孩子壹起觀看，漫畫的到社會肯定。
第五階段（二十世紀70~80年代中期）：“空氣時代”，漫畫已經成為青少年生活中不可分割的壹部分。
第六階段（二十世紀80年代中期以後）：“記號時代”，漫畫稱為青少年之間相互溝通的記號。