1．紅瑪瑙
紅色的瑪瑙，即古代的赤玉。紅瑪瑙中有東紅瑪瑙和西紅瑪瑙之分。前者是指天然含鐵的瑪瑙經加熱處理後形成的紅瑪瑙，又稱“燒紅瑪瑙”，其中包括鮮紅色，橙紅色。東紅瑪瑙壹名，因早年這種瑪瑙來自日本，故而得名。後者是指天然的紅色瑪瑙，其中有暗紅色者，也有艷紅色者，中國古代出土的瑪瑙均屬西紅瑪瑙，這種瑪瑙多來自西方，故而得名。
2．藍瑪瑙
指藍色或藍白色相間的瑪瑙。這是壹種顏色十分美麗的瑪瑙，塊度大者是玉雕的好料。優質者顏色深藍。次者顏色淺淡。藍白相間者也十分美麗，當有細紋帶構造時，則屬於纏絲瑪瑙中的品種。目前中國市場上產的藍瑪瑙制品，多半由人工染色而成，其色濃均，易與天然者區分。
3．紫瑪瑙
紫色瑪瑙。多呈單壹的紫色，優質者顏色如同紫晶，而且光亮。次者色淡，或不夠光亮，俗稱“悶”。紫瑪瑙在自然界不多見，亦有染色。
4．綠瑪瑙
綠色的瑪瑙，自然界不見綠瑪瑙，目前中國珠寶市場上的綠瑪瑙幾乎都是人工著色而成，·其色濃綠，有的色似翡翠，但有經驗者很易同翡翠區別。綠瑪瑙顏色“單薄”，質地無翠性，性脆；翡翠顏色“渾厚”質地有翠性，韌性大。
5．黑瑪瑙
黑色的瑪瑙。自然界少見黑瑪瑙，目前中國珠寶市場上的黑瑪瑙都是人工著色而成，其色濃黑，易與其他黑色玉石相混。以其硬度大於黑曜巖等區別。
6．白瑪瑙
以白色調為主或五色的瑪瑙。其中東北遼寧省產出的壹種所謂白瑪瑙，其實有的屬於白玉髓，多用於制作珠子，然後進行人工著色，可以著色成藍，綠，黑等色。這種白色瑪瑙，大塊者也用來作玉器原料，同時在局部染成俏色加以利用。然而，自然界也產出壹些白色瑪瑙，由於顏色不正，特別那些灰白色者，壹般不受人歡迎，但也可以用來制成壹些價格便宜的低檔的旅遊產品或旅遊紀念品。
7.雜草瑪瑙，又叫做苔蘚瑪瑙
8.水膽瑪瑙，顧名思義就是瑪瑙中包含有水，這種瑪瑙非常的稀有，是瑪瑙中的珍貴品種
9．其他顏色的瑪瑙
其他顏色的瑪瑙，均可按不同顏色加以命名。