雞糞的再次利用方法很多，可以采取傳統的雞糞堆積法或有機肥生物發酵法。傳統的雞糞發酵方法，是將雞糞堆積5～6個月左右，自然散發臭味，分解有害菌體，既對環境造成汙染又流失了雞糞中大量的營養成分，像有益微生物中蛋白酶、脂肪酶和澱粉酶酶等。而雞糞發酵 飼料方法是利用好旺農飼料發酵劑，大大加快發酵的時間，壹般是7天左右即可發酵完成，在發酵開始後有益微生物更是呈幾何級大量快速繁殖，消化吸收惡臭化合物，轉變成可供畜禽食用的蛋白質和微量元素，大大提高了雞糞的營養成分，肥效好，使用安全方便，受到廣大消費者的歡迎。
雞糞的加工處理方式多種多樣，有物理方法、化學方法、微生物發酵法、多種方式綜合法，其洋法與土法、古老與現代並存，各有優劣，應因地制宜。雞糞發酵作肥料的傳統老辦法是，讓其自然堆積發酵5~6個月，作飼料也要二十天或壹個月左右，這樣臭味散發,既汙染環境又造成養分大量流失。而用微生物發酵法處理雞糞，不僅能提高雞糞的營養價值，而且成本低廉，操作簡單，易於推廣，因而受到用戶歡迎。用發酵菌液處理，可使發酵過程大大加快，對工廠化大規模處理雞糞特別方便。但不同性能的發酵菌液的差異較大，體現在發酵時間長短不同，發酵菌液用量進而經濟成本不同，發酵操作繁簡程度進而勞動強度不同，發酵成品氣味顏色外觀狀況及菌體蛋白轉化、養分保存與提升情況，即成品品質不同，等等。本文對幾個發酵方法略作介紹，供有興趣者參考。
生物發酵劑發酵雞糞做肥料：
若用好旺農有機肥發酵劑菌液發酵雞糞，須20天腐熟，能無臭、無味、無害，堆肥松軟呈黃褐色，堆內有灰白色菌絲，有機質45%左右。操作：將幹雞糞呈長條狀平鋪在地上，按雞糞重的35%澆水，每噸雞糞撒好旺農菌液10公斤，應先加入米糠或麥麩稀釋，加過磷酸鈣15公斤除臭，加草粉或草炭100~150公斤。而後將堆肥翻倒兩三遍，堆成高約1米、寬2米的長方形物料堆，並在堆頂打孔通氣。最後用長方形塑料布將肥堆覆蓋，塑料布與地面相接觸，隔1米壓壹重物，使膜內既通風又避免被大風吹起。夏、秋季節早晚要揭膜通風壹次（1~2小時），天氣晴朗時可在頭壹天傍晚揭膜，次日早上覆蓋。堆漚4~6天後，堆溫可升至50~65℃。如為鮮雞糞，則先應在地上鋪壹層稭稈粉，也可用米糠、草粉、花生殼粉、草炭替代，然後將濕雞糞鋪在上面，按堆料重量撒入0.1%的尿素，按每噸重量撒入20公斤左右的過磷酸鈣，將10公斤好旺農有機肥發酵劑菌液與麩皮或米糠混合撒入。發酵過程中將堆肥翻倒兩遍，堆成寬1.5~2米、高1米左右、長度不限的堆，並用棍在堆內打通氣孔，蓋上塑料布保溫、保濕、保肥。應特別註意通風換氣。堆漚10天後可翻堆壹次，堆漚20天即能熟透。
雞糞發酵有機肥的方法：
步驟壹：拌勻發酵劑。1～1.5噸幹雞糞（鮮雞糞約2.5～3.5噸）加壹公斤好旺農有機肥生物發酵劑，每公斤的有機肥發酵劑平均加5～10公斤米糠或玉米、麩皮，攪拌均勻後撒入已準備好的雞糞中，效果最佳。
步驟二：調劑碳氮比。發酵雞糞的碳氮比應保持在25～30：1，酸堿度調到6～8（ph）為宜，因雞糞的碳氮比偏高，應在發酵時加入壹些稭稈、稻草、蘑菇渣等壹起發酵。
步驟三：調節雞糞水分。發酵有機肥料的過程中，水分含量是否適宜非常重要的，不能太高，也不能太低，應保持在60～65%，判斷方法：手緊抓壹把物料，指縫見水印但不滴水，落地能散開為宜。
步驟四：雞糞建堆。在做雞糞發酵堆時不能做的太小太矮，太小會影響發酵，高度壹般在1.5米左右，寬度2米左右，長度在2～4米以上的堆發酵效果較好。
步驟五：拌勻通氣。雞糞有機肥生物發酵劑是耗氧性微生物，所以在發酵過程中應加大供氧措施，做到拌勻、勤翻、通氣為宜，否則會因為厭氧發酵影響物料發酵效果。
步驟六：發酵完成。壹般在雞糞堆積48小時後，溫度會升至50～60℃，第三天可達65℃以上，在此高溫下翻倒壹次，壹般情況下，在發酵過程中會出現2～3次65℃以上的高溫，翻倒2～3次即可完成發酵，正常壹周左右可發酵完成，使物料徹底脫臭、發酵腐熟，滅菌殺蟲。