水上考古和路上考古的不同在於設備，使用的技術，還有研究手段。
它們之間的最大區別就是獲取材料的環境不同，水下考古是在水中進行，而陸地上的考古是在陸地上進行。因為環境的差異，所以考古的難易程度也是大大不同的，在水底下考古的難易程度遠遠大於陸地上的考古。而且參與水下的考古人員人數遠遠少於參加陸地上考古的人員。
人們在水下考古是不太容易的，需要考古人員會潛水技能，因為這項技能就讓有的路上的考古人員，而不能參與水中的考古工作，因為他們不適應水下的考古環境，而且水下的設備基本上使用著先進的海洋探測儀器，根據聲波和磁學來找尋文物所存在的地方，技術是十分新奇的。
水下考古也必須要依靠著水下潛水儀器，否則光依靠人力去潛水探索文物，是沒有辦法發現深層海底裏的文物的。利用水下潛水儀器，能更廣泛的探索到文物所在的地方，而且還可以通過它進行水下拍照，人們更確切的了解到它的形態。
不過最重要的是，在水裏長時間保存的文物，如果挖出到水外，如何進行保存也是壹門學問。眾所周知，如果將壹個文物從壹個地方挪到另壹個地方，需要更加好的保護，否則還不如不將這些文物挪出來。因為文物在水裏也許還是完好的，但是妳強行把它弄出水外，它有可能會受到自然的風化，從而失去其文物保護價值。
水下考古這是壹門很大的學問，還需要從很多方面去探解它的奧秘。