1、紅瑪瑙：紅是瑪瑙的壹種主色，壹般瑪瑙呈褐紅色、醬紅色、黃紅色。有些瑪瑙顏色表現不均勻，像南紅瑪瑙，其內部就有紅色的點。
2、藍瑪瑙：以淡藍色為主，色較深時透明度較差，有時在藍色瑪瑙中分布壹些其他色彩鮮艷的紋帶。
3、綠瑪瑙：天然產出的綠瑪瑙少見，優質者更為罕見，價格也相對提高。
4、紫瑪瑙：紫色瑪瑙較為少見，紫色有深有淺，其中以葡萄石最多，這類瑪瑙質地較粗，常常為半透明狀，但內蒙狼血瑪瑙紫色較為細膩。
5、黑瑪瑙：以黑色為主，微帶青色或灰色，多數為半透明狀。