該館現藏碑刻13co余方，其中宋代以來的傳世名碑、明清蘇州工商經濟碑刻是該館的珍貴藏品。還保存有明清以來的各類孤本、摹本拓片（本）200O余張（冊），也是館藏文物中的重要藏品。該館的基本陳列有：“孔子文化石刻資料陳列”。
“歷代書法藝術五到陳列”、“清代蘇州工商經濟碑刻陳列”、“古代蘇州農業經濟碑刻陳列”、“天文圖、地理圖、帝王紹運圖、平江圖碑刻陳列”、“儒學碑刻陳列”、“圖像碑刻陳列”等，其中以宋代“天文圖、地理圖、帝王紹運圖、平江圖碑刻陳列”、‘清代蘇州工商經濟碑刻陳列”具有代表性。宋代石刻四圖《平江圖》、《天文圖》、《地理圖》和《帝王紹運圖》，具有極高的歷史、科學價值。
《天文圖》
藏品有聞名於世的四通宋碑《天文圖》是世界上現存最古老的東方星象測繪圖，南宋黃裳作，淳佑七年（1247年）在蘇州按原圖刻石成碑；《天文圖》碑高3.7米，寬1.2米，分上、下兩部分：上為星圖，下為釋文。星圖以北極為中心，繪有1440顆星。釋文***41行，每行51字，計2091字，簡述了天體、地球、南北極、赤道及日月食成因等天文知識，內容豐富，方位準確，在世界古代天文學史上占有重要地位。
《地理圖》
《地理圖》是南宋黃裳作的中國全國性地圖，淳佑七年（1247年）在蘇州按原圖刻石成碑。它與現存西安的《華夷圖》和《禹跡圖》是現存我國最古老的三幅全國性地圖。碑亦分上圖下文兩部分，詳細刻畫出山脈、河流、湖海、森林、長城及各級行政機構路、府、軍、州的地位置，並將地名用“題榜”標明，極其醒目。刻圖與我國的地圖想對照，除海岸線出入較大，黃河、長江的發源地不清楚外，其余基本相符。下部釋文***645字，大致記述了自夏禹到南宋的歷代版圖變遷情況。 左下角沿有刻工王致遠的47字題跋。
《帝王紹運圖》
《帝王紹運圖》是我國古代帝王世系表，“紹運”即承上繼下之意。南宋黃裳作，采用圖表的方式，將古代3500多年的國名帝號排列得十分詳盡清楚。淳佑七年（1247年）在蘇州按原圖刻石成碑。《帝王紹運圖》碑高2米，寬1.1為，亦上圖下文。上部以圖表分左、中、右三路列出帝王世系，中路列出自黃帝起碼至南宋理宗止，***13個朝代247個帝號，另在左、右兩側列出秦六國、五代僭偽、春秋十二國、五胡十六國。下部釋文***550字，評述了古代“世道之理亂，五統之離合”，歌頌了宋太祖的立國之功。
《平江圖》
《平江圖》是南宋平江府城市平面圖，是我國現存歷史最久、最完整的城市平面圖，在世界上也是較早的城市平面圖，被立在前門西首。蘇州在南宋時稱為“平江”，碑圖因此得名。 圖碑高2米，寬1.33米，南宋紹定二年（1227年）呂梗等制。圖上把官署、寺觀、廟宇、園林、城墻、城門、河流、山脈等都詳細刻劃出，形象而準確地反映了當時蘇州城的城市和城市布局，是研究古代蘇州城市規劃的寶貴史料。
《天文圖》、《地理圖》和《帝王紹運圖》均為南宋黃裳所作。在戟門東部，辟有圖像室和儒學碑室，陳列不水則碑、府學碑、織造局圖碑以及歷代重修府學文廟等碑石。這些圖碑證明，700多年以前，中國人在天文學、地理學、史學和城市建設規劃等諸方面都取得了很高的成就。館藏碑刻1300余方，拓片3500多張，其中有列為全國首批重點文物保護單位的四大宋碑，反映明清資本主義萌芽的手工業和商業經濟碑刻、歷史名人畫像刻石、歷代儒學碑及書法叢貼等，匯集了蘇州碑刻的精華。
碑石展覽
該館展出的碑石，在戟門前豎有反映祖國邊疆統壹的大碑、儒學碑，戟門兩側，有宋代米友仁重修大成殿記等碑，戟門西二間則是四大宋碑與輔助性的陳列。東廊長148米，布置書法藝術性的“人帖”、過雲樓法帖、叢帖。西邊復廊，兩面布置223塊反映蘇州明清近代資本主義萌芽性質的經濟碑刻。大成殿內舉辦蘇州碑刻拓藝展覽，內容分人物史料、地方名勝古跡、圖像、書法藝術四大類。明倫堂內有範仲淹生平事跡展。西圍墻有現代書法名人碑廊，南圍墻有蘇州出土的歷代墓誌銘廊。
經濟碑刻
反映明清經濟碑刻是刻館的壹個重要組成部分，也是刻館藏品的壹大特色。在總長240米的西邊復廊中，陳列有226塊經濟碑刻，內容幾乎涉及社會生活的各個方面，特別是反映和記載蘇州手工業、商業資本主義萌芽的史料，更是受到國內外學術界的重視，可以補正歷史記載的不足。朝門與大成殿之間設有東西兩條碑廊。西廊陳列著工商經濟碑刻180多方，多數來自已廢會館公所的碑記，也有些是“奉憲勒石”的官府告示碑刻。
蘇州歷史碑刻拓片陳列
大成殿內辟有“蘇州歷史碑刻拓片陳列”，***展出拓片數百張，分歷史人物、名勝古跡、吳中文獻、書法藝術四大類，其中有不少是珍品弧本。其中《韓世忠墓神道碑》碑文長達13900多字， 碑石這雄偉，碑文字數之多，均屬國內罕見。圖像碑有孔子及七十二弟子像、白居易像、蘇東坡像、海瑞像、文征明像、顧炎武像、章太炎像等，十分珍貴。《滄浪亭圖》、《瑞光塔圖》等名勝古跡和晉陸機《平復帖》，三蘇手跡、祝允明草書、文征明行草等，皆屬書法珍品。
文徵明手跡碑刻
2004年7月21 日，壹塊珍貴的文徵明手跡碑刻在民宅中被掘出，落戶蘇州碑刻博物館。專家指出，這是目前發現的最大的文徵明手跡碑刻，具有相當高的史料價值。
書法作品簡介
作為歷史名域的蘇州，千百年來書法名家，刻石高手輩出，留下了許多各具風格的書法藝術作品。東廊設置的書法廊，長達120米， 集中陳列了《人貼》、《過雲樓法貼》和《叢貼》。《人貼》，為清嘉慶十壹年（1806年）兩江總督鐵保委托蘇州知府周春田摹刻，鹹豐八年（1858年）續刻，***五卷，匯集了範仲淹、文天祥及明代東林黨人、抗清誌士的手劄、詩稿、絕命詞及血疏等***32人的手跡，兼具書法和史料的雙重價值。《過去樓法貼》，清代所刻著名集貼之壹，以過雲樓秘藏書法珍品精選匯刻而成，其中大部分是由原本墨跡摹刻，壹部分則從所藏拓本中精選佳期本翻刻。內有褚遂良、定武、古本三種版本的《蘭亭貼》、釋智永《千字文》、文證明《落花千字文》等，都是難得的書法精品。
從貼
《從貼》，是從“環香堂”、“清暉閣”、“太虎齋”、“三松堂”等從貼中選出，重新編集而成，自晉“書聖”王羲之起，至唐、宋、元、明、清的名家法書，佳作如林。其中有範仲淹的《伯夷頌》，周天球、沈石田、文征明、唐伯虎、申時行等人的詩文，還有楊補之繪四種梅花及名人菊品刻石，祝枝山狂草字碑和林則徐、俞樾所書格言碑，也十分引人註目。