1，不同層次:首都博物館是集收藏、展覽、研究、考古、公眾教育、文化交流為壹體的博物館。是北京市大型綜合性博物館，中國省市級綜合性博物館。國家博物館是歷史與藝術並重，集收藏、展覽、研究、考古、公眾教育和文化交流於壹體的綜合性博物館。它屬於中國人民，屬於文化部。
2.地理位置不同:首都博物館位於北京長安街西延線，白雲路西側，復興門外大街16號；國家博物館位於北京市中心天安門廣場東側，東長安街南側，與人民大會堂對稱。
3.建築面積不同:國家博物館是世界上最大的博物館，總建築面積近20萬平方米。總用地面積7萬平方米。建築高42.5米，地上5層，地下2層。首都博物館總建築面積63，390平方米，是世界上最受歡迎的博物館之壹。
4.藏品數量和規模各不相同:首都博物館永久陳列數量為5622件，展廳地上五層，地下兩層。國家博物館總建築面積近20萬平方米，郭波藏品數量1萬余件，展廳數量48個。是中國文物收藏最豐富的博物館之壹，總體規模位居世界頂級博物館之列。