用於照明待檢測物體，
讓它發熒光，
然後在顯微鏡下觀察物體的形狀和位置。
1.照明方式通常是插話式的，即光源通過物鏡投射在樣品上；
2.光源是比普通顯微鏡波長更短、分辨率更高的紫外光；
3.有兩個特殊的濾鏡，光源前面的壹個用來濾除可見光，目鏡和物鏡之間的壹個用來濾除紫外線，保護人眼。
熒光顯微鏡也是光學顯微鏡的壹種，主要區別在於它們的激發波長不同。這就決定了熒光顯微鏡和普通光學顯微鏡在結構和用法上的區別。
熒光顯微鏡是免疫熒光細胞化學的基本工具。它由光源、濾板系統和光學系統組成。它利用壹定波長的光激發標本發出熒光，通過物鏡和目鏡系統放大，觀察標本的熒光圖像。