1、始建年代不同
南京夫子廟始建於東晉鹹康三年（337年）立太學於秦淮河南岸；北宋景祐元年（1034年），移東晉學宮於秦淮河北 ；
南京新街口清朝同治年間，新街口地名出現，它最初是指糖坊橋至明瓦廊之間的壹條狹長的街道。1929年12月完成的《首都計劃》將新街口規劃為商業區
2、地理位置不同
南京夫子廟位於南京市秦淮區秦淮河北岸貢院街、江南貢院以西，地處夫子廟秦淮風光帶核心區，即南京孔廟、南京文廟、文宣王廟。
南京新街口位於南京市中心區域，以新街口廣場（孫中山銅像）為標誌，擁有百年歷史，被譽為“中華第壹商圈”?。
擴展資料：
根據有關規劃，大新街口商圈的區域為：東至太平南路、太平北路，南至建鄴路、白下路，西至莫愁路、上海路，北至長江路、華僑路。
新街口商圈核心區域為：東至洪武路、洪武北路，南至石鼓路、淮海路，西至王府大街、管家橋，北至長江路、華僑路。
新街口商圈內同業商家聚集的功能街區有“洪武路金融街”、“正洪路商業步行街”、“太平南路黃金珠寶壹條街”、“王府美食街”、“石鼓路酒吧街”、“冶山民俗文化街”、 “朝西古玩字畫壹條街”、“莫愁路古玩壹條街”、“長江路文化壹條街”、“倉巷明清壹條街”、“淮海路民國文化壹條街”等。
百度百科—新街口（南京市新街口）
百度百科—南京夫子廟