第7集（工藤要被小蘭識破，博士假扮自己幫他圓場）
劇情簡介：小川醫生這兩年來不斷收到未署名的錢和玩具，實在是不知道來歷，於是前往毛利偵探事務所求助。在柯南的提示下小五郎推理出玩具其實是中古品，而小蘭也因此開始懷疑起柯南的身份。在前往小川醫生工作的醫院調查過程中看到柯南翻閱病例的小蘭對柯南的懷疑也進壹步加深。最終柯南在千鈞壹發之際成功解救了小川醫生的孩子。而柯南也成功化解了小蘭的懷疑。
第97集（工藤要被某人識破，工藤有希子及時幫忙圓場）
劇情簡介：破解密碼後，元康留下的線索居然是……案件解決之後，小蘭找借口把柯南帶到了工藤家，並戳穿柯南就是新壹的身份，這時，工藤的母親有希子從美國回來，在她的幫助下，柯南逃過了小蘭的質問。 次日，有希子帶柯南來到鄉下，原來她是受兒時朋友廣美所托，來鑒別剛從巴西回來的叔父義房的「真假」，晚上，義房說他早就知道大家的懷疑，並從身上拿出壹封恐嚇信。
第188集（因為血型相同被小蘭懷疑，在暴露身份時灰原圓場）
劇情簡介：看著奄奄壹息的柯南，步美建議大家自己想辦法，三人按照石頭上的文字推斷出了出口方位又利用蝙蝠逃出了洞穴，歹徒也遭到逮捕。緊接著柯南被立刻送到醫院進行治療，又在小蘭碰巧知道血型的情況下給他輸了血，小蘭最近的奇怪反應讓柯南意識到自己的身份或許已經在小蘭面前暴露，就在他打算向小蘭坦白時，灰原拿槍對準柯南。
第400集（小蘭翻柯南的手機，差點查到有關工藤身份的信息）
劇情簡介：小蘭開始懷疑柯南的身份就是新壹，拾到柯南遺落的手機的小蘭，想用發送手機郵件的方法來確認真相。當小蘭按下了電源開關，卻出現手機解鎖的畫面。正當她為解除4位密碼冥思苦想時，小蘭回想起半年前與新壹的約會並解出了密碼。但發送給新壹的郵件卻並沒有發送到柯南的手機上，而這時新壹也打來了詢問的電話，最終小蘭打消了對柯南的懷疑。
擴展資料：
劇場版《世紀末的魔術師》（連續被小蘭懷疑兩次，被逼要開口承認時，基德假扮工藤圓場）
劇情簡介：在城堡中，柯南意外發現通往地下室的通道，在秘道中珠寶商乾被殺。而其他人在壹個棺木中發現了第二個蛋，並明白了回憶之卵的真正含義。但專門狙擊人右眼的神秘殺手“史考兵”也在人群之中。他再次行動，
目標是小五郎和小蘭，刺殺失敗後兇手搶走了彩蛋，並想燒毀城堡。柯南追趕兇手，在熊熊大火中，兇手露出了她的真面目。柯南在白鳥的幫助下逃出了火海。回家後小蘭對柯南的真實身份再次起了疑問，正當柯南要說出真相時，新壹出現了...