1、浸泡：先打壹盆清水，最好是溫水，不要太熱，30度左右吧。然後把妳要清理的金剛菩提子手串扔到水盆裏(買來的金剛菩提子手串先不要急著把繩子解開，整串的扔到盆裏)，等待他完全慢慢的沈入水底後，就不用管他了。在裏邊浸泡上10幾個小時吧。
2、平刷:十幾個小時甚至壹天後，拿出來，兩個人壹人抓壹頭把金剛串拉平(如果只有自己的話，可以找壹個木板，壹頭頂上釘子來代替另外壹個人)。拉平後，用鋼絲刷以垂直角度平刷，刷的時候不要把刷子狠狠的壓在珠子上，而是應該像我們用掃帚掃床上的渣子壹樣的方法。這樣可以使珠子轉動起來，以保證每個地方都能刷到。刷十幾下把金剛菩提子手串轉轉，以保證離手近的那部分也能被刷到。
3、洗渣，重刷：刷完後，把金剛菩提子手串在扔回水盆裏，用手使勁攪，讓刷下來的渣滓洗下來。攪完後，再換壹盆溫水，泡上幾個小時候，用硬毛刷像第二步那樣刷壹下刷。其實基本進行到這裏就差不多了。如果覺得還不幹凈，可以重復以上的操作。
4、搓幹：把留下的金剛撈出來放到壹塊幹布上，然後兜起來使勁甩壹甩，用手隔著布輕輕搓壹搓，這樣是為了把大部分水甩到揉到布上，感覺布很濕了，就換到另外壹塊幹布上，用手平揉珠子，這樣幾次後，珠子表面的水分就基本幹了，可是滲透進內部的水石不可能完全弄出來的。