博物館設有基本陳列和臨時陳列等展區。壹樓是宿遷文明基本展歷史，分為四個部分:第壹部分:文明開端，徐淮奠基，展示宿遷從遠古到夏商周時期；第二部分:楚漢時期的葉巍，壹個重要的郡縣，講述了秦漢至南北朝時期的宿遷故事；第三部分:水運樞紐——淮北名城，展現隋唐至明清時期的宿遷；第四部分:社會轉型與地域重生，介紹清末民國至新中國成立前的宿遷。
二樓為臨時展廳，可承辦書畫、錢幣、文物展等各類展覽。
所有展覽均以實物為主，圖片、文字、場景均有還原。直觀系統地展示宿遷地區楚漢文化、酒文化、運河文化的亮點，通過參觀展覽可以全面了解和掌握宿遷地區的歷史發展。