昌吉回族自治州屬於新疆維吾爾自治區，位於天山北麓、準噶爾盆地東南緣，東與哈密市接壤，西與石河子市接壤，南與吐魯番市、巴音郭楞蒙古自治州接壤，北與塔城、阿勒泰接壤，東北與蒙古接壤。
昌吉回族自治州是新疆絲綢之路經濟帶核心區的重要組成部分。它曾是古絲綢之路新北方路線通往中亞和歐洲的必經之路。自古以來就是西域的咽喉，北疆的屏障。