學院秉承“尊重道德，提高能力”的校訓，以“面向市場，突出技能，服務就業，提高質量”的質量方針，緊緊圍繞烏昌經濟壹體化要求和昌吉州六大支柱產業發展，註重專業結構調整，大力發展電力系統自動化技術、電力系統自動化技術(清潔能源方向)、電氣自動化技術、機電設備維護與管理、機電壹體化、火電設備及應用、建築工程技術、礦山機電等自治區級專業和區域產業發展急需專業建設，先後成為中央職業教育專項資金支持的電氣工程及自動化控制技術實訓基地、昌吉特色產業(機電)實訓基地、 昌吉旅遊人才培訓基地，新疆煤、煤、電、煤化工人才培訓基地，中央財政支持的火電設備及應用培訓基地，國家高技能人才培訓基地建設單位。 昌吉職業技術學院已成為重要的職業技術人才培養基地和區州職業教育的領頭羊。
截至目前，學院七個院系已與100多家企業對接，其中大型企業占80%，常年與多家大型企業進行培訓。與企業崗位密切相關的技能課程教學任務由企業師傅完成，實現了專業與行業、課程與崗位、教學內容與職業資格標準、教師與技術人員、課堂與生產車間、教學與生產流程、教學與生產考核等等。通過制定人才培養計劃、編寫教材、建立實習基地、培養學生、開展考核等方式，深化了校企深度融合，提高了人才培養質量，畢業生就業質量和社會服務能力大幅提升。學院以崗位導向的職業資格證書為依托，對人才培養過程進行整體設計、統籌安排、分段實施。在校期間，學生可獲得高級司爐工職業資格證書、電工操作證、集控值班員證、CAD繪圖員證、焊接操作證、計算機等級證、高級維修電工證、電工操作證、職業英語AB證、數控操作員證、繪圖員建造師證、質檢員證等。
學院堅持育人為本、德育為先的原則，將責任、誠信、敬業、紀律、創新、競爭、合作、服務、效率、質量等職場生存和發展所必需的意識和理念滲透到教育教學過程中，重視對學生的職業道德教育和法制教育，註重培養學生的誠信、敬業精神和責任感，以及遵紀守法意識。把綜合素質教育放在非常重要的位置，合理分配教學內容中“理論高度、專業深度、文化厚度”的比重；遵循"科學技術為人文奠定基礎，人文知識為科學導航"的理念，根據高職學生的特點，先後編寫了《人文知識讀本》、《通識讀本》和《高職人文素質基礎教程》，為高職教育的高質量進行了有益的嘗試。同時，學院還培養學生的唱歌、跳舞等綜合素質。
學院先後榮獲全國職業教育先進單位、自治區示範性職業學院、首批20個國家高技能人才培訓基地、全國校園文化建設優秀成果優秀獎、自治區大學生思想政治教育督導評估優秀單位、自治區職業培訓先進單位、自治區文明單位、自治區依法治校示範學校、自治區和自治州勞動模範之家。