東京的愛麗絲學園（全稱：國立愛麗絲研究機關學園本部）是壹所特別的學校，只招收具有特殊能力「愛麗絲」的人，壹旦入學就要等到畢業才可以離開學校。
青梅竹馬、猶如姐妹般的玩伴今井螢招呼也不打壹聲就從鄉間小學轉入城裏的學校，佐倉蜜柑無論如何都無法接受這個事實，於是離家出走，只身來到螢所在的愛麗絲學園，但卻發現自己根本無法進入學園。在圍墻外徘徊的她險些被人販子拐走，所幸被學園的鳴海老師搭救並發現蜜柑可能具有愛麗絲能力，於是「順理成章」地入駐愛麗絲學園。
嶄新的學園生活對蜜柑而言是喜憂參半。喜的是終於和螢團聚，憂的則是跟問題學生日向棗分在同壹班級兼同桌還是拍檔，更令蜜柑跌破眼鏡的是她滿心歡喜入駐的學園竟然是學生們公認的囚籠，而日向棗更是厭惡學園派的典型。
即來之則安之,即便遭到同學們的排擠，即便被評定為無星級,即便不清楚自己的愛麗絲是什麽，即便見不到相依為命的爺爺，不服輸的蜜柑仍然沒有放棄。
原本只是追逐螢的步伐而來到愛麗絲學園的蜜柑，也最終在這裏收獲了歡樂、勇氣該作用語
愛麗絲
擁有天賦才能的力量以及有那個能力之人的總稱，這部作品的主軸。
各式各樣的種類都有，對大眾有用的愛麗絲到如技藝壹般的愛麗絲都有。因為是出生就持有的天賦才能，雖然有喜歡自己愛麗絲的人,但討厭自己愛麗絲能力的人也不少。因為從孩子發現有愛麗絲起，來自愛麗絲學園的勸誘（老師）和打算綁架的人（or 人口販賣子）非常多，所以不希望自己的孩子是個愛麗絲的父母較多。
擁有愛麗絲的方法目前確認有兩種。壹個是像是蜜柑和棗壹樣是父母的愛麗絲遺傳的類型，另壹個是像螢那樣，父母並非愛麗絲而本人卻作為愛麗絲出生的類型（目前此種愛麗絲類型還尚未有明確地解釋由來）。
愛麗絲學園
保護作為愛麗絲孩子並教育他們為第壹目的，初、中、高直升式的全員住宿制學校。高等部與壹般學校不同，因為是五年制，二十歲才能畢業。愛麗絲能力者有像翼和美咲尚未懂事就被發現，或像行平泉水長大之後才發現自己是愛麗絲能力者，再加上能力出現的時期會根據人也不同，入學時期七零八落。不過，最低入學年齡是三歲。
愛麗絲學園設有初等部（三歲至八歲在A班，九歲至十二歲在B班）、中等部及高等部（高中和大學兩年），校園占地極之廣闊，範圍大部份是森林，除了校舍和宿舍外，校園中心有商店市鎮。為了防止學生逃出學校，校方以電網包圍整個校園，觸碰到電網的人會受到電擊且即時被發現。若學生取得優等生獎，可以獲準探鄉壹星期的特權
據說學園的畢業生們結婚的比例是占70％。入學到畢業都不能與父母相見也無法通訊。和外面唯壹聯絡方式只有信。學園會檢查信件內容〔螢曾經為了能給蜜柑回信就故意寫了壹封壹定可以通過檢查卻內容冷淡的名信片〕甚至扣押寄給學生的信件。也會有部分學生因為被親人拋棄並拒絕與孩子聯系而無法與外界交流。
表面是將不擅長控制自己愛麗絲的孩子入學園以保護做為目的，不過，也有像棗壹樣被迫去做黑暗工作。
由於不讓家人見孩子，還讓孩子做危險的工作的事等，因此來自外部與內部的排斥也不少。
但也有不少像安積柚香、小泉月那樣因為擁有愛麗絲而被父母狠心拋棄的孩子。
設置著星階級制度。幹部生（特級星）、三星、二星、壹星、無星，各個階層影響平時的生活待遇和零用錢等。
花園會
中等部校長私有的「花姬」美少女沙龍。
由被待挑選的女學生，舉行著每個季節大規模的活動。而被選中的女學生“花姬”每人都會有個花名。主要是中等部以上的女學生為征選對象。
校長因為討厭男人，所以男子絕對是禁止出入。所以棗、流架、陽壹為了進入花園會不得不男扮女裝。
ZERO
愛麗絲學園敵對的反體制組織，通稱「Z」。為了讓感到被愛麗絲學園利用了的畢業生，向愛麗絲學園報復所組成進而組織化。可是因為像柚香壹樣逃離的人也不少。曾說打算將持有愛麗絲的人解放後誘拐、洗腦，且打算賣掉等行為。
愛麗絲能力班別
潛在能力系
簡稱「潛在系」。壹般人所熟知的超能力大多數被歸入此系（人數相對其他能力系較多）。
例如讀心、透視、幻術等能力。
代表人物：飛田裕、心讀君、神野老師等
技術系
在發明、研究、創造中滲入愛麗絲能力。工具發明、藥品試制、在物品中註入靈魂、演奏出治愈心靈的音樂、烹制有生命力的糕點等。
代表人物：今井螢、園生要、岬老師等
體質系
天生便具有影響動物或人的心誌的荷爾蒙;和肢體運動有關的,如高速跑,飛翔等.
代表人物：乃木流架、正田堇、鳴海老師等
特別能力系
簡稱「特力系」。不屬於以上三個系的學生全部被劃分到這裏,能力樣式五花八門，比較雜亂。例如無效化、影子操控、分身的能力等。這壹系的學生相對較少，常被其他系的學生嗤之以鼻。
代表人物：佐倉蜜柑、原田美咲、野田老師等
危險能力系
這班別的學生其實來自以上四類系別.
集中了能力「特殊」和「危險」的學生.對外宣稱給予他們特殊保護,實際上是將這些能力超卓的孩子作為政府的特殊部隊進行重點培養,替學園完成各種「特殊任務」.
學園不願向外界公開這個系的存在，甚至在學園的正式名冊上都沒有該系學生的記錄.學園活動也不能允許他們正式參加.
代表人物：日向棗、茨木野薔薇、Persona等
星階級
無星級
屬於被認為無能的壹類，或者是被校方覺得學生的愛麗絲對學校沒利益的學生。
壹星級
給予剛入學的愛麗絲學生或是表現壹般的學生。
二星級
給予愛麗絲能力優秀的學生/因為考試考的好，從壹星升上二星的學生。
三星級
給予愛麗絲能力優秀的學生/成績優秀或是從二星升上三星的愛麗絲學生。
幹部生（特別星級）
給予愛麗絲能力優秀的學生/特殊的愛麗絲學生/優秀的學生/從三星升上特別星的愛麗絲學生。
學園每個月向學生發放零用錢，不同星階級的人所得的錢如下：
無星級：500圓（動畫是5拉比特）
壹星級：3000圓（動畫是30拉比特）
二星級：5000圓（動畫是50拉比特）
三星級：10000圓（動畫是100拉比特）
幹部生（特別星級）：30000圓（動畫是300拉比特、信任以及友情……
初等部 人物簡介
佐倉蜜柑（佐倉蜜柑）
CV：植田佳奈（日本）；雷碧文（臺灣）；莊巧怡／王夢華（香港）
主角
佐倉蜜柑 11歲〔1月1日出生 牧羊座〕
血型O型
發型通常是雙馬尾。關西腔。
開朗性格能感染他人。有能把愛麗絲消除的「無效化愛麗絲」。初等部B組6年級。因為與「過去的事件」的中心人物有相同愛麗絲，所以被學園監視及判以無星。特別能力系。初期因曾被棗「性搔擾」而敵視他。救出被綁架的棗後，升格壹星。了解棗後漸漸喜歡他。
花名是「橘之君」。後來發現有能從他人或自己身體將愛麗絲以愛麗絲結晶石（簡稱愛麗絲石）的形式取出與將愛麗絲石植入體內的「盜竊愛麗絲」（或譯「盜取愛麗絲」和「竊取愛麗絲」），此後被久遠寺校長逼迫。愛麗絲石的顏色是蜜柑色。被久遠寺校長強制轉到危險能力系。和棗逃避風紀隊的追捕，到中等部花公主殿（或譯花姬殿）後用櫻野的愛麗絲石瞬間移動到高等部校長室。跟野田到了時間空間，看見愛麗絲學園的過去。
今井螢（今井蛍今井蛍）
CV：釘宮理惠（日本）；馮嘉德（臺灣）；陳琴雲／黃鳳兒（香港）
11歲(10月25日出生 天蠍座)
血型AB型
蜜柑最好的朋友。有話直說，不轉彎抹角。有能發明不可思議東西的「發明愛麗絲」，作品得到外間企業的好評。初等部B組6年級的副班長。技術系。三星，幹部候補生。
花名是「若紫」。愛麗絲石的顏色是混雜了水色的紫色。幫助蜜柑和棗逃避風紀隊的追捕，敵不過風紀隊被捕，後被颯所救，到中等部花公主殿後用櫻野給蜜柑的愛麗絲石瞬間移動到高等部校長室。跟野田到了時間空間，看見愛麗絲學園的過去。
日向棗（日向棗日向棗）
CV：樸璐美（日本）；龍顯蕙（臺灣）；姜麗儀／鄧潔麗（香港）
11歲(11月27日出生 射手座)
血型B型
性格外冷內熱。有能產生及自由操縱火焰的「炎之愛麗絲」，每次使用都會縮短壽命的類型。為保護妹妹而被迫進入學園和危險能力系。執行任務時戴著黑貓形的「愛麗絲完全制卸面具」，綽號「黑貓」。執行過多任務，身體虛弱。
初等部B組6年級。幹部生，學生會成員。初期對好朋友流架外的人緊閉心房，後來受蜜柑改變，對蜜柑和友人敞開心房。給蜜柑起了諸如「水珠」、「草莓花紋」等綽號(or 昵稱?).
5年級時是蜜柑的拍擋。隨著漸漸了解蜜柑後喜歡上了她。花名是「紅蓮之君」。愛麗絲石的顏色是酒紅色。救出妹妹後為保護蜜柑而留在學園。和蜜柑壹同逃避風紀隊的追捕，到中等部花公主殿後用櫻野給蜜柑的愛麗絲石瞬間移動到高等部校長室。跟野田到了時間空間，看見愛麗絲學園的過去。
乃木流架（乃木流架）
CV：安田美和（日本）；劉如蘋（臺灣）；譚淑英／陳琴雲（香港）
11歲〔3月16日出生 雙魚座〕
乃木流架 血型O型
棗的好朋友。喜愛動物，有被動物喜愛及能與動物溝通的「動物荷爾蒙愛麗絲」。初等部B組6年級。體質系。三星。常抱著壹只免子，被蜜柑和翼稱為流架兔。隨著漸漸了解蜜柑後喜歡上了她。
花名是「向日葵之君」。愛麗絲石的顏色是奶白色。幫助蜜柑和棗逃避風紀隊的追捕，被野田帶到高等部校長室。跟野田到了時間空間，看見愛麗絲學園的過去。
飛田裕（飛田裕）
CV：大浦冬華（日本）；龍顯蕙（臺灣）；羅嘉玲（香港）
12歲(6月14日出生 雙子座)
血型A型
有能讓他人看見幻覺的「幻覺愛麗絲」。初等部B組6年級的班長，通稱班長〔或譯委員長)，成績優秀。潛在能力系。三星，幹部候補生。
愛麗絲石的顏色是翡翠綠色。曾經被柚香偷去愛麗絲，後來恢復。幫助蜜柑和棗逃避風紀隊的追捕，敵不過風紀隊並被捕。
正田堇（正田スミレ）
CV：齋藤千和（日本）；劉如蘋（臺灣）；陳琴雲（香港）
12歲(5月31日出生 雙子座)
血型B型
有與狗及貓壹樣的超嗅覺、直覺的「犬貓體質愛麗絲」，使用愛麗絲時會生出與狗及貓壹樣的耳朵、須和尾巴。初等部B組6年級。喜歡棗和流架，自封棗和流架Fans Club會長。
初期討厭蜜柑，之後二人關系逐漸轉好。被蜜柑、心讀君和狐貍眼君稱為燙發（或譯卷發）。體質系。二星。愛麗絲石的顏色是淺紅色。幫助蜜柑和棗逃避風紀隊的追捕，敵不過風紀隊並被捕。
心讀君（心読み君）
CV：松元恵（日本）；馮嘉德（臺灣）；鄧潔麗（香港）
10歲(3月18日出生 雙魚座)
血型AB型。經常掛著笑容但嘴巴很壞，性格奔放自由。擁有「讀心術愛麗絲」。初等部B組5年級。潛在能力系。壹星。初等部A組時是堇的拍擋。以前曾是個孤僻的孩子。幫助蜜柑和棗逃避風紀隊的追捕，敵不過風紀隊並被捕。
小笠原野乃子（小笠原野乃子）
CV：野中藍（日本）；吳小藝（香港）
10歲〔9月26日出生 天秤座〕
血型A型
有能調制出奇怪藥物的「制藥愛麗絲」。初等部B組5年級。技術系。壹星。愛麗絲石的顏色是粉紅色。喜歡岬老師。幫助蜜柑和棗逃避風紀隊的追捕，敵不過風紀隊並被捕。
梅宮安娜（梅ノ宮アンナ）
CV：神田理江（日本）；姜麗儀（香港）
10歲(3月2日出生 雙魚座）
血型A型
野乃子的好朋友。有能制作出奇怪料理的「料理愛麗絲」。初等部B組5年級。技術系。壹星。愛麗絲石的顏色是粉紅色。喜歡岬老師。幫助蜜柑和棗逃避風紀隊的追捕，敵不過風紀隊並被捕。
狐貍眼君（キツネ目君）
CV：細野雅世（日本）；譚淑英（香港）
11歲〔4月4日出生 白羊座〕血型O型。心讀君的好朋友。有能把自己的身體飄浮在半空中的「浮遊愛麗絲」。初等部B組5年級。潛在能力系。壹星。容易和他人相處。幫助蜜柑和棗逃避風紀隊的追捕，敵不過風紀隊並被捕。
聖陽壹（聖陽壹）
CV：齋藤千和（日本）；鄧潔麗（香港）
4歲〔4月13日出生 白羊座〕
血型AB型。
通稱小陽（或譯小陽壹）。有能召喚惡靈的「召靈愛麗絲」。初等部A組。危險能力系，綽號「惡魔使者」。壹星。吃了螢的變身糖果，長大10歲，因糖果的副作用而不能恢復原型，故穿上伸縮性70%的特制衣服，因而得到身體能隨意變大或變小的「特異體質愛麗絲」。幫助蜜柑和棗逃避風紀隊的追捕，敵不過風紀隊並被捕。
宇佐美和歌子（宇佐美和歌子）
CV：上田純子（日本）；吳小藝（香港）
動畫版原創角色。
擁有「使物件瞬間移動愛麗絲」。初等部B組。潛在能力系。壹星。經常與堇壹起活動，自封棗和流架Fans Club會員，稱堇為會長。
星野保誌雄（星野保誌雄）
別名小保（或譯小星）。有「天氣愛麗絲」，只有兒時才有能力形式。現在沒有愛麗絲。戴著愛麗絲制卸面具。蜜柑以前的同班同學。初等部B組4年級。特別能力系。估計自己的愛麗絲將會消失，因此保留愛麗絲石，在離開學園時為同學送上象征幸福的彩虹。
小泉月（小泉月）
外表12歲〔4月4日出生 白羊座〕
血型AB型。
有「吸魂愛麗絲」，能吸取對方少許靈魂，再把自己些許的愛麗絲吹進對方體內，控制對方的意誌，或是壹口氣吸去對方大量的靈魂，導致對方身體衰弱甚至死亡，每次使用都會縮短壽命形式。在柚香11歲時，被父母舍棄而進入學園。因為自身的愛麗絲，被其他學生盡量避開，因此變得孤獨及內向。很想結識朋友，之後跟柚香成為朋友。特別學生。因受久遠寺校長認同和重視，決定努力替他執行任務。
中等部1年級，要對同學用愛麗絲時，被柚香不小心盜去了愛麗絲，認為柚香令自己再次孤獨而變得憎恨她，成為學園暗部的刺客。聽從久遠寺校長的指示，不知用什麽方法把自己變小，轉到初等部B組去逼迫蜜柑。棗6年級時的拍檔。體質系。愛麗絲石的顏色是紅紫色。追捕蜜柑和棗中。