清水巖，鐘靈毓秀，宛如天仙，自古至今是朝聖、旅遊的洞天福地。這裏山水景觀絢麗多姿，文物古跡資源豐富。巖石嶙峋，千姿萬象，如獅如虎，似人似物，無不神肖神似；雲霧婀娜，妙趣橫生，時而來去匆匆，時而含情脈脈。名勝古跡，古建築，摩崖石刻，與山名山勢甚相契合；幽亭曲榭，因朝聖攬勝而立；古今詩聯，意蘊濃郁。經調查，現存的文物古跡有66處，其中宋代有29處，元代的1處，明代的8處，清代的5處，已湮沒的16處，風物景觀23處。當今，美妙蓬萊，人間仙境。高殿聳然，亭榭錯雜，清山綠水風光好，引來壹拔壹拔的香客虔誠、遊客歡笑。 蓬萊仙山
為清水巖主體景區，主峰海拔767米，是清水巖的第壹高峰。蓬萊峰北面植被茂密且分布著眾多景點，自然和人文景觀價值較高，南面山勢較陡，散布形態各異的巖石。山頂目前建有壹座電視轉播塔和壹座移動信號發射塔。站在山頂上整個蓬萊鎮區盡收眼底，蘭溪從景區東面蜿蜒直至遠方，頗有壹覽眾山小的氣勢。
春晨靈霧
清水巖上天氣變化無常，晴雨不定，雲霧繚繞。每年農歷三月初壹日，儀式。相傳：當天淩晨，由山下仰望清水巖，如果霧罩峰頂兆示頂庵堂拈得大旗，霧圍峰中兆示中庵堂拈得大旗，霧漫山麓平原兆示下庵堂拈得大旗。年年如是，靈應異常。
岫谷龍噓
巖東試劍石下，壹股嶙峋聳拔的險崖，若隱若現在森郁的岫松之間，每當晨昏，輕煙縷縷，霧氣騰騰，恍若龍噓成雲，盤繞於巒岫壑谷，展播於極頂，巔峰雲笠，更為奇觀。
霧海浮嶂
春深夏秋之晨，立於清水山莊廊上，展目壹望，繚繞薄霧，彌漫眼前。壹到朝陽初露，八面四周，遠嶂漸現，如浮仙山。山下余霧，泛泛蕩蕩，恍如仙境。
雙溪躍月
巖後東北隅新建涼亭處，夏秋月夜，遊人憩涼亭，瞰湖頭溪、蓬萊溪兩川匯合處，月影在兩溪間晃動，浮光躍金。 三忠廟
始建無考。據民間相傳，三忠廟原址在今法門內近小池之處，前曾挖出覆盆式的柱礎石，並於巖坑邊挖到古時砌疊有序的階石，即當年張巖之故址。巖祀張巡為首，故曰張巖。宋元豐年間，祖師於張巖之側營造清水巖，而將張巖遷在覺亭侖，並名為“三忠廟”，即今“枝枝朝北” 古樟樹旁。據舊《巖誌》載：“廟在覺亭之外，祀唐宋三忠臣”。
歷代相傳，廟原祀張巡、許遠和伍子胥。後明太祖朱元璋將伍子胥請出，將嶽飛請入。從此，“天下”的“三忠廟”祀張巡、許遠、嶽飛。清光緒戊子年楊淩版《清水巖誌略》載：“巖有三忠廟，祀宋張世傑、陸秀夫、文天祥也。”不知何時，廟中增祀關羽，雖名“三忠廟”，實祀四位忠臣英靈。
自古迄今，清水巖寺“佛生日”，“開香”之日下夜，和尚列隊從祖師中殿隨旗鼓及三庵堂三頭人，三支“都會槍”到“三忠廟”恭請“三忠火”。1988年，華僑周玉明、卓進卿、柯金鳳等十四人捐資重建“三忠廟”，重檐歇山式構築，坐向乙辛辰戊。廟前立置石獅，更顯廟堂莊重典雅
廟前石獅壹對，為光緒年間（1875-1908年）東溪僑商陳天常募獻，原置於祖殿巖庭，因石獅較小，於壹九八八年移置於三忠廟前。
護界宮
宮在巖下北坡、古道曲繞、路側壹坦處，宮始建於宋，內供奉“護界將軍”、左“千裏眼”、右“順風耳”三神。千百年來，屢損屢修，屢塌屢建。1988年農歷十月初九日，臺北龍泉巖祖師信眾壹行62人到巖進香，捐資重建。宮前對聯：“千裏眼瞻是非世態，順風耳辯善惡心聲。”系劉坤貞撰，王愛琛書。
半嶺亭
舊誌載：祖師營築巖寺後，即在半嶺築亭，供遊客小憇，名曰半嶺亭。亭較為簡陋，多次崩塌，屢經修建重建。民國十五年（1936年）重建；1956年重修。1986年改建，亭為琉璃屋蓋，條石重檐赭壁。
綸音壇（石櫃壇）
綸音壇，俗稱“石櫃壇”，在覺亭對面、“六老同遊”碑之後。據壇左邊垛陰刻記載，壇建於元延祐四年（1317年），也就是巖寺火災之後，經巖住僧壹果、崇遠師徒重建巖宇後的文物。壇總高3.30米，主體為壹大石櫃，櫃上有壹石塔，塔高2.20米，塔臺高1.10米，寬1.38米，浮雕著翔龍和“皇帝誥命”及“敕賜昭應廣惠慈濟善利大師”的陰刻篆字。石櫃高2.75米，寬6.11米，厚2.50米。正面記載清水祖師四次榮受宋廷敕封的綸音牒文，左邊垛陰刻元延祐年間巖宇重建的記事。
清水法門
清水法門為舊時巖寺山門。內供奉趙、王、蘇、李四大將，乃巖寺護法神。法門前石柱刻聯壹對：“眾山旋繞朝清水，四將莊嚴護法門”。 門額壹匾，刻“清水法門”四字，顏體楷書；款識：“辛酉年夏日啟謨白鴻”。（註：白鴻，字啟謨）
覺 亭
覺亭為“枝枝朝北”古樟所蔭，本是小茶棚，明萬歷辛醜（1601）年，邑令廖同春倡修改建，並取“遜惺轉念，壹覺即是”之義而命名為“覺亭”，意在警醒世之迷者也。清道光、光緒年間曾先後重修，民國十五年（1926）再修；壹九四九年後坍凈，壹九八壹年，由華僑劉發炎捐資重建。式樣依舊，采鋼筋混水泥構築，亭四周石欄環護，仿木鬥拱，重疊回護。亭四周陰翳郁郁，俯瞰橫眺，凡陵麓之變幻，溪澗之浮沈，俱在眼底。遊客壹路貫穿林蔭，到此壹覺，真乃“禪林第壹關”。
覺亭今尚存舊聯三對，其中門聯壹對：“貤封宋基室，膜拜仰真人”。石柱聯兩對 “夢覺無雙路，禪林第壹關”、“客插塵中腳，人昂天外頭”。
祈雨臺
臺在巖後壹裏許之山頭。傳祖師當年在此築臺祈雨，旁有雷公電母兩石，均已被毀。為再現祖師“天人合壹，人定勝天”的理念與及“法雨花天，得力在是”的靈應，2003年，港胞林樹哲先生等捐資50萬元，在原址上重建祈雨臺。
重建的“祖師祈雨臺”總平面尺寸約39.00×43.50米，占地1696.50m2；法臺平面尺寸12.00×12.00米，面積144.00 m2；臺高分別為4.95米、1.95米、1.35米，總高度8.25米。主體為巖石承重結構。外觀為石結構城墻式高臺，臺墻為仿古花崗石墻；臺上石雕龍望柱四根。整個外觀，遠看高臺雄偉壯觀粗獷，近觀須彌座及龍望柱小巧玲瓏、工藝精細。高臺上的雙祭臺及祭臺的八角形意含上天廿八宿；方形的法臺、臺中的圓圈意含天地方圓；總三個臺，意含三重天；高臺計三十三個臺階意含佛教三十三天；十二根石柱意含壹年十二個月；四根龍望柱意含壹年四個季節。
“祈雨臺”三字石匾為中國書法家協會副主席劉藝題。
清水山門
1988年秋，清水山門建立於鶴前大橋頭上巖的入口處。門坊的正中門高5.50米，寬4.00米，左右邊門各高5.00米，寬1.80米，原蓋琉璃瓦，飛檐出水，總高8.00米。石坊刻著中國佛學院教授、書法家虞愚先生題寫的《清水巖》牌額和“拜參千佛坐；同享十方春”的對聯。坊上邊柱鐫刻楷寫的“拓建柏油公路芳名”系泉州王愛琛所書。今清水山門，莊嚴肅穆，堂皇矗立。 真空寶塔
清水祖師圓寂後，鄉人將其舍利葬於殿後，築塔覆亭於其上，名曰“真空塔”，是喻祖師圓寂時已了悟真空、得道成佛。塔高2.30米，底座六角形，每角邊長0.70米。中圓股，圍1.60米，高0.48米；頂蓮瓣，圍2.00米，高0.20米；下蓮瓣，圍2.35米，高0.20米；桔瓣，圍2.00米，高0.20米；六翹角塔蓋高0.20米，塔尖0.40米。宋嘉定四年（1211年），長泰縣令、邑人余克濟撰《真空寶塔記》。
1988年冬，華僑柯長義夫婦和廖榮業夫婦捐資重建“真空寶塔”亭。亭高10.00米，亭內四方柱各高3.05米，柱徑0.36米×0.36米，橫梁各0.36米×0.36米，三挺構築，上挺高1.10米，中挺高1.30米。沿亭的階石及周圍浮雕，系菲僑蔡清洗先生等40余人捐建。“真空塔亭”4字行體，系廈門李躍年所書。
楊道塔
塔在海會院右側，是楊道圓寂後的葬塔，迄今已有800多年歷史。塔原無文字，僧禮缽查勘後，於塔圓股上陰刻“宋楊道先祖塔”六字。楊道，清水祖師大弟子，相傳曾於祖師生前受邀住持平和三平寺，祖師圓寂前召回，接受衣缽。1997年，歸僑劉金玉女士捐資重修。
西竺墓
墓在在老寮外，葬西竺公。明萬歷間，巖西軒派第三代僧西竺公，住持清水巖有年，曾任安溪縣僧會司。歷版的安溪縣誌都在僧會司職位上註空缺字樣，而巖誌可補縣誌之不足。可見西竺在當時的宗教界處於權威地位。圓寂後，墓在老寮映月池處。乾隆二十六年，邑令宋應麟清巖界時立碑。
普同塔
塔在智慧墓塔與禮缽塔墓中間，原系三合土灰構築。系明代住僧***葬壹區之所。從何年起，未有明記。至1966年廢。
清比丘先祖墓
清代文物古跡。清乾隆年間，釋澤峰住持巖寺，在覺路頂、羅漢松外之處，築此僧墳。年久碑失墳壞，僅留墳桌和拱手等。1985年，從其墳桌麒麟處，細辨字刻，系澤峰為前眾僧所築之墳，後立“比丘”石碑留念。
智慧僧塔
清代文物古跡。智慧，俗名“咼公”。清同治十年（1871年）住巖，光緒年間（1875-1908年）住持清水巖。素行清高，籌修巖寺，頗著功跡，收錄弟子70多人，分布遠近。清宣統元年（1909年）在巖圓寂，墳塔築於三忠廟外，今祖師文化長廊中段之橫路頂，立有碑石。
禮缽僧塔
1941年，僧禮缽住持清水巖。自宋至民國，歷經千年風雨的清水巖，僧禮缽清貧奉佛，率徒鼎力籌資修繕，恢復寺貌，事跡甚豐。1957年，僧禮缽在巖圓寂，葬於清水巖山莊後橫路頂。1966年，由徒將其骨骸遷移於清風洞埋葬。1983年秋，又遷回原葬地，築塔紀念，塔前豎石經幢壹對。 出米石
宋代文物古跡。為壹巨石，突兀立於弘法道場往海會院路旁（舊時老寮處），石無所依，上以楷書鐫刻：“頭陀應員等開墾蔬園十餘丘，無水灌溉，於鹹淳丙寅春，佛旨出泉，引為萬年清潤者。”***33字。石刻版幅：寬0.85米，高1.22米。舊誌載：“石在覺亭外路下，宋淳熙間，開辟蔬園，無水可灌，壹日佛指而杖之，水即流出，混混不竭。噫，自無造有，是亦大師之顯化靈跡也。勒之日出水石，至今猶令人賞奇觀焉。俗稱出米石者，據閩中摭聞所載，謂石隙出米以餉工，工竣而米竭雲。”
又傳，每遇旱時，清水祖師即立石上為民禱雨，得沛甘霖。既有水，農田可播，亦即有米，故又稱“出米石”。巖宇昊天口壹幅篆書對聯：“饋貧糧聚巖前米，濟世恩深缽底龍”。是前賢施芳勝對出水石的寫照。
至今，石的半腰間的孔隙中，長年尚有積水，但無溢出。石刻“鹹淳”，舊誌載“淳熙”，究竟石“出水”於何時，待考。
裂 竹
法門外翠竹叢下崖石上陰刻隸書“裂竹”兩字。字徑高0.8米，寬0.50米。
龍 淵
在方鑒塘下，深淵壑谷之處。從浮杉池的方井中，鉆越隧洞，即見兩石相撐，跨山澗拱立，水從兩石間註出，汩汩有聲，上下四周，森蔭密遮，涼沁入脾。澗崖壁上篆體陰刻“靈淵”兩字，字徑0.7米見方，未標何人何時所書。傳說，古時，信眾禱雨，汲回澗淵之水，可得滂沱。
洗 心
護界宮內，森郁迂回的曲徑崖壁上，陰刻行書“洗心”兩字，字徑0.70米見方，未落款。是處，林陰古道，泉水淙淙，如洗塵心，如滌俗穢。置此其間，無不神怡。
六老同遊
明代文物古跡。碑在覺亭對面、綸音壇之前的摩崖石上，陰刻楷書：“萬歷戊戌冬十月，晉江莊國禎、林雲程、黃鳳翔、林喬相，南安歐陽模，安溪詹仰庇同遊此。”***字三十四字，摩崖版幅高2.25米，寬0.98米。六老相邀同遊清水巖，詠詩題刻，成為千古佳話。
曲水流觴
明代文物古跡。碑在方鑒塘之左、舊跡清珠簾之外，其處削壁千仞，上鐫刻著：“萬歷辛醜春日，建覺亭，開覺路，引水流觴，***醉千仞岡頭。清溪令廖同春偕邑士紳李椿、詹仰憲。”鐫版高2.60米，寬0.74米。
功德林
明代文物古跡。碑在蓬萊坊故址間的摩崖上，豎書陰楷“功德林”3字，字徑各0.33米見方，版高1.18米，寬0.53米。署款：“萬歷辛醜裏人□佳喜舍”字樣。款中□字被鑿，已無考。
喜舍緣銀
清代文物古跡。碑在覺亭內、“功德林”對面的巖石上，楷書陰刻：“漳州府龍溪縣廿七都池宅社龍池宮林眾弟子，喜舍緣銀五十兩，內三十四兩買起崇善裏巖山土名深內租佃壹十五栳，配民米壹鬥四升，付清水巖東西住僧收管，歷年以為祖師佛前香燈之資，其余銀系修理巖宇，立石為記。溪頭柯士□，喜舍佃租壹栳。”
石刻版幅0.54米，高0.80米。
又於楊道塔路下石上刻：“漳州龍溪縣龍池官，喜舍田園路頂及路下二鬥，租六栳，敬奉清水寺。道光已亥年立。”
人間天上
民國時期文物古跡。碑在清水巖寺左崖石壁上，陰刻著顏楷“人間天上”四字，字徑約1米見方。上款“清水巖”，下款“益陽王道純”。王道純，1946年安溪縣縣長，來巖覽勝留題。
佛字石刻
在祖師殿後，獅猴崖壁，陰鐫行書，字徑2.20米×1.70米， 1948年為主持僧禮缽所書。
鬼洞
鬼洞右邊石壁上鐫刻著“鬼洞”兩字行楷，字徑各1.30米見方，為書法家王愛琛書。
梁披雲石刻
鬼洞左側巨石崖壁上，鐫刻 “魔氛壹掃，清水如來”八字行書，為著名詩人、書法家梁披雲所書。
曲徑
碑在方鑒塘內峭壁間，陰刻“曲徑”。款識：“覺路通寺內，原道較狹，不適優遊，旅星僑胞柯保安先生，捐資增辟此路，曲徑通幽。歲次丙寅荔月立”。版幅：高0.77米，寬0.65米，為王愛琛書。
試劍石
巖宇之左，有座“削”半的巖石。相傳，當年祖師與山鬼試劍比法，被削去的巉石。“試劍石”3字，陰刻行書，字徑高2.20米，寬2.05米，1987冬為仙遊書法家鄭良懷所書。民國時期，漳平知事劉維立題詩：
蓬萊仙境
清水巖，素有“蓬萊仙境”之美譽。1991全國政協副主席、中國佛教協會會長趙樸初先生題“蓬萊仙境”四字贈送清水巖，現勒刻於海會院後之石峰，字徑各二米見方。
公壽題刻
碑在海會院後石徑上側巨石上，與“清水靈巖”碑相鄰。草書陰刻：“紫氣東來沖雲天，爆竹聲聲迎新年，壬林歡飲申江酒，碑林喜見清水巖”。下款：“清水碑林留念 公壽於神墨碑林。”版幅高3.20米，寬1.80米。
清水靈巖
碑在海會院後石徑上側巨石上，行書陰刻“清水靈巖”，版幅高4.00米，寬3.00米。為上海書法家任政七十六高齡時書。
王壹琴題刻
碑在九曲十八洞西側之崖石上，版幅巨大，行草書體，陰刻：“名山勝景，氣勢壯觀”。為書法家王壹琴所書。
幽 靜
碑在望雲亭後邊之巖石上，楷書陰刻“幽靜”二字，上款“清水巖”，下款：“星洲柯賢樹伯丘書。”版高1.20米，寬1.00米。柯賢樹（1893-1980年）原籍福建安溪蓬萊鎮蓬溪村，曾任新加坡安溪會館第十九屆至第二十二屆常務主席。
清 水
書法碑刻，碑在浮杉池旁，與“曲徑”碑相鄰，隸書，字徑高0.35米，寬0.50米，無款識。 枝枝朝北
枝枝朝北千年古樟在蓬山主峰中侖、覺亭之畔，聳天雄踞。此樟相傳為祖師手植，樹高31米，圍6.90米，主幹勁直，而枝葉均迂回北拂，故得名“枝枝朝北”，為清水古地壹大奇觀。朝北古樟頗具靈性，其北拱之枝葉回護三忠廟，似以表證“三忠”向北之耿耿忠心。又傳，祖師家鄉永春在巖之北，此樹枝技北向，表達了祖師的思鄉之情。
另據舊誌載，昔有官府派人到巖，欲砍此樟造船，巖寺住僧極力勸阻不止，匠人動斧，差人七孔鮮血，匠亦自傷其足，始知乃神樹也。
羅漢松
樹在覺路之上，近“聖泉”處，與祖殿隔路相望。舊誌載：“此松祖師手植也。松枝向殿前，老樹橫枝，至徑直上，不敢侵徑，旱時吐霧生煙，七百余年，不改其柯，枝枝朝佛焉。”傳此樹每年長三寸、遇雷電則矮三分，今樹高13.00米，圍1.33米。
母子樹
真空塔亭左邊頂上，有古樟壹株，早以斷尾梢。樹外圍6.60米，高10.00米。樹心空洞，圓心直徑1.86米，數人可圍坐樹中，仰望天空，甚為奇觀。古樟樹離地1.40米的皮層處，長出樟樹壹株，俗稱“母子樹”。今樹圍0.66米，高9.60米，枝葉扶疏，長勢良好。樹左離地4.00處，又抽發出幼樹壹株，生機旺盛，煞是好看。
千年古藤
“裂竹”之外有壹古藤纏繞而橫於路之上方，凡入寺巖必經其下而過。此藤名厚果崖豆藤，纏繞綿延不知幾裏，已被列入福建樹木奇觀。
裂竹
明代文物古跡。法門外的崖石旁，有翠竹壹叢，翠竹叢下崖石上陰刻隸書“裂竹”兩字。字徑高0.8米，寬0.50米。傳說，有孕婦到巖將娩，依麻竹坐下生嬰兒，而竹破裂攬護婦孩，日後此孩科舉有名。
別有天
壹老樟樹，在覺路中段，破覺路之面而直上，樹齡古老，樹高參天，枝枝亦朝北，似朝北古樟之兄弟樹。樹心已中空大半，遊人將頭伸入其中仰望，有二洞眼可望蒼天，別有壹番情趣。民間尚有傳說，此樹心原藏有巨莽壹條，性情溫順，每逢雨則出洞捕食山鼠充饑，而從不傷人。
古木新裝
覺路之下、杉木林中，有壹參天古榆，彎曲別致，歷盡蒼桑，其腰身之上寄長榕樹壹株，
梅園
覺路之上壹小園，植有寒梅數株，冬春之際，繁花盛開，如白雪壓枝，別有情致。寒風飄逸，暗香撲鼻，沁人心脾。
聖泉
泉在“曲水流觴”外，泉自石出，秋冬不涸，味清且冽，為宋代古跡。舊誌陳希實在《聖泉序》稱：“正出曰泉，通明曰聖，亦以見大師謙讓通靈之意。”遊人到此，飲之清心，沐之祛穢，瓶裝帶回噴灑庭院，用以驅災凝祥。
方鑒塘
俗稱“浮杉池”，塘在靈淵之上，法門之前。原系方沼塘，澗泉匯註，水清可鑒。昔時歷經整修，以禳火災。“方鑒塘”取天光雲影之意，喻池水之清澈。明廖令曾在塘石之上，鐫“泉石盟”三字，後塘廢，字失。1947年，巖崖迸趵，塘受山洪沖壞，僧禮缽略加整修。1985年，添置“荷蛙”、“躍鯉”、“遊蝦”、“壽龜”等石雕噴泉。塘中立有觀音聖像，正對覺路，笑迎眾詣巖禮佛之客。塘四周崖壁仞立，林蔭泉盛，意境清幽。 獅喉
為壹天然天然大石磡，在清水祖殿祖師座後，磡連頂殿。磡洞中可容數十人，洞內有孔穴，圓口徑0.60米，長年細水滴潤，微風徐徐，如喉喘氣，雅稱“獅喉”。此處為祖師當年修煉及坐化處。傳在此祈願，靈驗無比。
火化臺
宋代文物古跡。臺在弘法道場清水祖師造像之左，為壹塊大石與數塊小石累堆而成，似臺似墳，據傳乃當年祖師示寂火化之處，亦為歷代住巖僧眾圓寂火化之所。
石 船
石在護界宮外、古道壹側，乃巨石壹塊，狀如起錨行馳的船舶，甚為奇觀。
石蒸籠
石在護界宮右側後方、石船對面的山坡上，為層疊奇石，形似上下兩層的蒸籠，矗立在森郁林中，若隱若現，煞是好看。
小鬼弄金獅
石在石蒸籠侖下、清水古道之側，舊跡四洲佛近處，為兩挺立奇石，壹似金獅，壹如小鬼，二石互為戲弄，神肖神似，俗稱“小鬼戲金獅”。
仙腳跡石
石在北坡四洲佛附近、古道之旁，方形，石上有足趾頭、足腕等痕跡，古稱“仙腳跡石”。
丹 臼
石在半嶺亭侖頂的山坳之間，崖石壹窟，稱為“丹臼”。傳說，當年清水祖師常在此舂煉丹藥，留有余香，猛虎常來舔舐成窟，貯水不幹。
藥 砧
石在半嶺亭邊，狀如棋盤，俗稱“藥砧”，是當年祖師采搗草藥之處。
袈裟石
石在半嶺亭西側路坡間。傳祖師當年外出回巖，常在此石稍坐憩息，身上袈裟，影入石中，而顯“田”字的袈裟紋於石上，故稱“袈裟石”。
無字天碑
巖頂峰有壹巨大巉石，狀如石碑，挺於石上，混沌迷糊，並有蝌蚪文字，甚為奇特。
石 筍
石在巖主峰西南斜坡間，拔地屹立，嶙峋直挺，高14米，儼若天柱，勢幹青雲，稱為“石筍”，是巖石中千姿百態之獨特者。跨越石頂，俯瞰坡下，頓感昏眩。
神移石故跡
1947年農歷七月二十九日，天空烏雲濃得化不開，狂風大作，雨猛烈得沒章法，肆虐的山洪襲擊巖寺。頃刻間，殿左危崖上，轟隆壹聲巨響，壹塊巨石翻滾直下，飛越寺頂，不偏不倚，墜落殿左天井正中，寺瓦無損，殿墻無礙，人稱“神移石”。僧禮缽聘匠劈石，充修殿墻。
鬼 洞
在巖宇護樓後有壹個天然的石洞，巖石上有陰文“鬼洞”行楷兩字，傳說清水祖師曾施法力將鬼怪幽禁於此，以免傷害百性。
九曲十八洞
海會院頂坡的陡崖間，怪石嶙峋，千姿百態，有的伏如猛虎，有的臥如巨犀，有的利若刀鋒，有的植如柱笏等不可勝計。犬牙交錯，迂回展曲，構成了十八個“洞天”，斜貫相連。洞口荊榛陰翳，洞中陰涼幽靜，入其境，別有壹番情趣。兼之峰高露多，嵐潮氣濕，雖在暑夏，洞石尚甚潤滑，林濤飄漾，沁入心胸，真有慧風心中漫，浮雲足下生之感，令人流連忘返！
壹線天
浮杉池之上。石徑曲折，兩側壁立，行走其間，舉頭仰望，天猶壹線。 巖圖碑
碑在綸音壇後之亭內，系兩石合攏之浮雕。碑高2.9米，寬0.98米，厚0.15米。正面上額篆刻“巖圖”二字，字下浮雕刻載宋代清水巖的殿閣、亭臺、山門、舍利塔、道路等，並附有當時巖宇詳細的建築度數，是全國罕見的珍貴碑刻。
舊誌載：住持僧惠清開始恢廣殿宇，後於景炎丁醜年（1277年）間火災，巖宇為圩。後再由住持僧壹果、崇遠師徒重建完善，是南宋時代的遺物。1987年，華僑林東茂、劉文察兩位先生捐資修建護碑亭，重檐式構築，覆護著巖圖碑。亭高6.60米，磨光六角石柱各高2.80米，橫梁各0.45米。
佛國碑
舊誌載，佛國碑為巖寺界碑。碑上“佛國”二字相傳為祖師手書，原有兩碑。其中壹塊今立於清水巖西麓、彭格村路旁山坡間。碑背面有“南無阿彌陀佛”六字，傳為宋朱熹所書。另壹塊立於鶴前村頭供埕的坡麓間，1966年被毀，1987年重立，字跡已失原貎。
“東土如來”題匾
明末弘光年間，邑令周宗壁為贊譽祖師，手書“東土如來”四字，立木匾壹方，懸於殿額。字徑各高0.60米，寬0.50米。匾長2.70米，寬0.95米。
新立匾額
20世紀80年代後期，新立懸於祖師殿梁上的匾額“萬家生佛”，和臨摹於弘壹法師的“慧光普照”、“萬古英靈”、“感應”、“清水佑民”、“清水有靈”等。