為紀念美國友人約翰·馬吉先生在建校時，特別是在侵華日軍南京大屠殺期間，為南京人民做出的特殊歷史貢獻，南京市第十二中學圖書館被命名為“約翰·馬吉圖書館”。早在1912年，約翰·馬吉先生就被美國聖公會派到中國南京傳教，並在這裏生活了28年。南京下關道生堂是他的主要活動場所。1917年創辦基督教會“逸致小學”，後改名為“道生小學”、“道生中學”，是南京市第十二中學的前身。學校成立時，有六棟樓。雖然歷經80多年的風雨和戰亂，但由於精心維護和反復修繕，整個建築群仍保存完好。1992年3月，道生堂舊址被列為南京市文物保護單位。
1937年侵華日軍在南京進行慘絕人寰的大屠殺期間，約翰·馬吉先生擔任國際紅十字會南京委員會主席和南京安全區國際委員會委員，為受傷的難民設立醫院，參與搶救20多萬面臨大屠殺的中國人民，與20多位留在南京的西方人譜寫了感人的人道主義樂章。不僅如此，他還冒著生命危險，用16毫米相機秘密拍攝了日本侵略者在南京犯下的暴行。影片長達105分鐘，是唯壹壹部關於侵華日軍南京大屠殺的動態畫面，成為揭露日軍暴行的鐵證。