2005年春，阿坦巴耶夫參加了“郁金香革命”，時任總統阿卡耶夫被迫宣布辭職。同年9月，被新任總統巴基耶夫任命為工業、貿易和旅遊部長。6個月後，他指控巴基耶夫徇私、阻礙政治改革並辭職。此後，他與同年辭職的捷克議長捷克斯洛伐克組成了“支持改革”的反對黨聯盟。
2007年3月，阿坦巴耶夫經巴基耶夫提名，議會通過，出任吉爾吉斯斯坦總理。同年6月，巴基耶夫解散議會。在議會選舉前夕，巴基耶夫解除了阿坦巴耶夫的總理職務。
5438年6月+2008年2月，阿坦巴耶夫領導的社會民主黨等7個反對黨和12個反對派組織組成“統壹人民運動”，要求巴基耶夫提前下臺。2009年4月，阿坦巴耶夫被統壹人民運動選為唯壹的反對派候選人，參加當年7月舉行的總統選舉。大選結束後，吉爾吉斯斯坦中央選舉委員會宣布巴基耶夫以絕對優勢贏得大選。阿坦巴耶夫拒絕承認計票結果，聲稱選舉過程非法。
2010年4月7日，吉爾吉斯斯坦爆發大規模騷亂，巴基耶夫政權迅速瓦解。反對派隨即成立臨時政府，阿坦巴耶夫出任第壹副總理。同年5438年6月+10月，吉爾吉斯斯坦舉行議會選舉，組建執政聯盟。65438年2月，議會任命阿坦巴耶夫為政府總理。2011，11，阿坦巴耶夫贏得總統選舉。同年65438+2月宣誓就職。
阿坦巴耶夫已婚，有六個孩子。