長惠、王鹽高速公路、長圖鐵路、東北東部鐵路通道等重要交通幹線橫貫東西，連接南北。州內8個縣市由高等級公路相連，通過鐵路和公路與俄羅斯和朝鮮相連。連接省會城市的吉琿鐵路客運專線有望年內建成，琿馬鐵路國際聯運貨運將投入試運行。海運方面，琿春至俄羅斯紮魯比諾、韓國束草的國際陸海聯運航線和琿春至中國上海(寧波)的國內貨物跨境運輸航線實現常態化運營。
航空方面，已開通至北京、上海、廣州、深圳、首爾、朝鮮平壤、俄羅斯符拉迪沃斯托克等多條國內外航線。2014年，延吉機場旅客吞吐量達到124萬人次，其中國際遊客51000人次，是東北地區第五大機場，在全國支線機場中保持領先水平。2015年9月3日，高鐵在延邊開通，給延邊的旅遊發展帶來了巨大的活力。