北海道和東北有時會把納豆和糖混在壹起。用蛋黃醬吃也有創意。如果不攪拌就加醬，水太多，粘度會降低。洋蔥和芥末可以抑制“納豆氨”的刺鼻氣味。不習慣吃納豆的以為是爛煮黃豆。
生產方法:
傳統方法是將蒸熟的黃豆用稻草包裹，將稻草浸泡在100度的開水中殺菌消毒，並在40攝氏度下保溫壹天。吸管上常見的枯草芽孢桿菌(納豆芽孢桿菌)由於能產生芽孢，耐熱性高，殺菌過程不被破壞。
高溫培養速度還能抑制其他菌株，使大豆發酵後產生粘絲。這種粘稠的外觀主要來自谷氨酸，谷氨酸被認為是納豆美味的來源。
在20世紀後期獲得高質量的吸管並不容易，大多數都是裝在聚苯乙烯泡沫塑料或紙質容器中出售的。所以現代的生產方法是將蒸熟的大豆與人工培養的納豆菌混合，然後直接放入容器中發酵。大豆以外的壹些食物也可以做成納豆。
在制作清酒時，如果生米不慎被納豆菌汙染，釀造所需的酵母就會因其繁殖速度快而受到抑制。清酒釀造處不允許使用納豆，其他發酵食品也可能有類似情況，所以在工藝上要多加註意。