日本中醫和中醫應該是同根同源的。中醫在秦漢時期傳入日本。明治維新後，日本全面引進西方醫學體系，從根本上排斥中醫，導致其幾乎滅絕。從70年代開始，疑難雜癥越來越多，主要是老年病，西醫束手無策，而且西醫對人體副作用大，價格昂貴，於是中醫逐漸興起。1976年，日本厚生勞動省確定了中醫方劑的醫療保險制度，即批準中國《傷寒論》中的210個中醫古方可用於制作中醫方劑，中醫行業發展迅速。
根據日本社會研究所的統計數據，普遍使用中國藥方的廠家從196年的92家增加到099年的111家，品種也從196增加到2154家。中醫藥在老年病和慢性病的治療中得到廣泛應用，承認中醫藥療效的醫生逐漸增多。目前72%的醫生使用中藥，其中70%的醫生已經使用了10年。