過去，由於未能正確掌握修復和保護紙莎草卷的方法，大量的埃及和阿拉伯伊斯蘭紙莎草卷被毀。原本掛在埃及博物館臺階上的紙莎草卷軸壹直暴露在陽光下，最終自燃。正確的保存方法是將紙莎草紙夾在玻璃片之間，既能防止灰塵和水的侵蝕，又能避免高溫和光線的照射。此外，紙莎草卷應嚴格按照技術規範進行展示。
目前，紙莎草紙在其他阿拉伯國家的地位比埃及好。埃及國家圖書館中的紙莎草文獻雖然具有重要的學術價值，但由於長期無人問津，正在不斷惡化，急需修復和維護。除此之外，從未整理編目過，除了粗略研究過的幾百卷，其余都被束之高閣。專家學者呼籲在埃及建立壹個專門的阿拉伯紙莎草卷博物館，以拯救瀕臨滅絕的文化遺產。
據悉，意大利拿波裏博物館收藏的紙莎草卷自燃後碳化變黑，只有用紅外攝影技術拍攝後才能鑒定。其他狀況不佳的紙莎草卷軸也需要特殊的修復技術進行修復。
阿拉伯和伊斯蘭紙莎草卷在世界各地流失是不爭的事實，主要在美國，如芝加哥大學、密歇根大學、賓夕法尼亞大學、柏林博物館、貝爾蘇拉大學、路德維希大學、吉森大學、海德堡大學、利特馬裏茨、慕尼黑、明斯特、斯特拉斯堡、布拉格、華沙、巴黎、倫敦大學、大英博物館、劍橋漢字和曼徹斯特圖書館。散落在阿拉伯國家個人手中的紙莎草紙當然存在，但很難統計和知道。目前，阿拉伯國家還沒有設立專門的機構來研究紙莎草卷。因此，要弄清紙莎草卷的確切數量是非常困難的，需要官方相關機構的介入。