壹元硬幣牡丹圖案與菊花圖案區別如下：
1、發行時間
壹元牡丹硬幣從1991年開始發行，壹直到2000年停止發行，屬於第四套人民幣。
壹元菊花硬幣從1999年開始發行，至今仍在市面上流通，也就是我們現在所使用的壹元硬幣，屬於第五套人民幣。
2、花紋圖案
壹元牡丹硬幣正面印牡丹圖案、背面印國徽。壹元菊花硬幣正面是“1元”的面值、背面是菊花圖案。
3、收藏價值
壹元牡丹硬幣最具收藏價值的是千禧龍年(2000年)牡丹壹元硬幣，因為它本身就是作為收藏品發售在《2000年版中國硬幣》裝幀冊當中，並未在市場流通，再加上“關門幣”的特性，單枚市場價格在1000元到1200元之間。其他年份的牡丹壹元硬幣屬於市場流通幣，所以具體發行量並不為人知，市場價格也存在些許差異。
壹元菊花硬幣由於仍在流通中，市場價格波動比較大，參考性比較小，絕大部分年份市場罕有成交，其中卷幣盒幣比較能體現其市場價值，未來升值空間巨大，較具有收藏價值。
百度百科-硬幣