壹般來說，蝴蝶蘭的花也有蘭科的共性——三片外花瓣，兩翼壹唇六瓣，壹雄壹雌雌蕊。
頂瓣:有人稱之為萼瓣，因為它長在最外層，由萼形成。三塊是三角形的，每壹塊大小差不多，但最上面的壹塊叫頂瓣，左右兩邊的兩塊叫側瓣或腹瓣。
翼瓣:兩片花瓣橫向展開，也是蝴蝶蘭最美的部分。它們的大小和顏色通常是壹樣的。它們和唇瓣是壹樣的，但是在外觀上有很大的不同。
唇瓣:蝴蝶蘭的唇瓣不僅不同於同壹朵花的花瓣，而且因品種不同而差異很大。它的唇瓣通常是三瓣，有些唇瓣壹眼就能明顯分開。中間前面的那個叫預裂或中裂片，常為三角形，邊緣彎曲，兩側的其他側裂片常垂直向上環繞雌蕊。
唇瓣的側裂片之間產生壹個連體塊，與雌蕊下面的兩個塊體相連。壹方面目的是為了吸引昆蟲，另壹方面便於雌蕊接觸並帶走或傳播花粉粒。
此外，在壹些蝴蝶蘭中，唇中的裂片也有頂端有兩圈的花絲，壹般稱為卷須。
柱頭:壹般雌雄花獨立存在，但蘭花最大的特點是雄性。雌蕊生長在唇瓣的中心，合並成壹個脊狀的雌蕊。雌蕊在雌蕊的內側，雄蕊在柱頭的頂端，柱頭是蘭花所有生殖器官的重要組成部分。蝴蝶蘭的雌蕊呈桿狀，雌蕊頂端(俗稱鼻頭)有壹個帽狀花粉蓋，很容易去除。它還有壹個與小粉盤相連的粉柄，粉盤有粘性，可以附著在授粉媒介上。
花藥隔膜:位於頂端以下的隔膜，以防止其花粉(雄性)與其後凹陷中的柱頭(雌蕊-柱頭)自花授粉。雌蕊柱頭的凹坑裏有粘液，用來吸花粉。