重慶中國三峽博物館在重慶博物館的基礎上發展得已具相當的規模，擁有各類文物近百萬余件，各類珍貴圖書、資料十萬余件。
在眾多的藏品中，出土文物以巴蜀文化遺物，四川漢畫像磚、畫像 、石陶俑，元末大夏開國皇帝明玉珍睿陵遺物為馳名。傳世文物中，宋以來名家書畫、歷代名窯瓷器、明清紫砂、歷代錢幣、各代碑帖、玉器、竹木牙骨器、絲綢和西南民族文物等，均有較系統的收藏。本館收藏的近現代文物也豐富而有特色，對四川及重慶近代以來的太平天國、重慶教案、開埠設關、蜀中同盟會、中***四川地下黨、抗戰陪都和正面戰場等重要的歷史進程，都有形象的文物資料以反映。本館還註意選取重要的典型性實物和四川各地民間工藝品的代表性實物入藏，以便在展覽中形象地再現各族人民的現實生活。
館藏文物約10萬多件，資料5萬多件，具有重要歷史、藝術價值的珍品有：四川舊石器 500多件，巴蜀文物1000余件，漢畫像石、畫像磚100多件，歷代名窯陶瓷器4000多件，宋元以來名家書畫5000多件。該館還藏有著名歷史人物明玉珍、張獻忠、秦良玉、鄒容等人的遺物手跡，以及齊白石、張大千、徐悲鴻、朱宣鹹、蘇葆楨等傑出畫家的作品。近現代文物約 3萬件，其中有太平天國、重慶教案、辛亥革命、五四運動、紅軍長征、抗日戰爭等重大歷史事件的文物資料。此外，還有西南民族文物，包括羌、藏、彜、苗、土家等族的工藝美術品5000多件。