終於考取的韓愈，先入國子監成為四科博士，壹年多後升任監國史。然而，就在他升官後不久，他因彈劾謊報災情而遭到報復，被貶為連州縣令。然而，這壹年多來，韓愈又被召回北京，接下來的幾年他壹直在北京工作。五年後，韓愈再次被貶為河南縣令，壹年後再次回京。
韓愈屢遭貶謫與他剛正不阿的性格有很大關系，甚至有壹次因為他的建議差點被唐憲宗處死。唐朝的國教雖然是道教，但這壹時期佛教也很流行。唐朝的國王中有許多佛教徒，唐憲宗是其中之壹。唐憲宗是個非常信佛的人，元和十四年，他想把玉鳳祥法門寺的壹塊佛骨迎回皇宮，以便隨時供奉。唐憲宗的決定在當時也引起了很多討論，韓愈得知後，甚至不顧生死上書獻策。
韓愈在《佛骨表》的訓誡中，非常直接地陳述了歡迎佛骨的荒謬，甚至要求唐憲宗毀掉佛骨，不讓它繼續蠱惑人心。唐憲宗看到這篇諫文後非常生氣，覺得自己信仰的佛教受到了侮辱，想把韓愈處死。好在很多朝臣得知後都極力勸阻韓愈。唐憲宗打消了處死韓愈的念頭，但韓愈卻因為這件事再次被逐出京城。