1、斷口鑒別，玻璃斷口的式樣大家都很熟悉，是光滑彎曲如貝殼的凹痕；而水晶是礦石，斷口處能夠看出石質感，而且水晶是結晶體，斷面不會出現玻璃那樣的痕跡。
2、熱導檢測，將熱導儀調節到綠色4格測試寶石，天然水晶能上升至黃色2格，當面積大時上升至黃色壹格，而假水晶不上升。
3、憑手感，水晶都是晶體，傳熱快，玻璃為非晶質，傳熱慢。所以手握水晶會感到冰涼入心，佩帶壹小會兒之後，便與體溫同步；而玻璃則有溫感。
4、測硬度，硬度天然水晶的硬度為7，而玻璃只有5，因此測試時，只要硬度大於5的物體都可以劃花玻璃。
5、看價格，壹分錢壹分貨，即使是天然的水晶也分多個等級，價格也就是有了天壤之別。天然黃水晶本來質量好的就不多所以不要指望著能花便宜錢買到3A級的黃水晶，越好的水晶越昂貴。
6、發絲鑒定（雙折射），發絲鑒定專門針對圓球狀晶體：將水晶放在壹根頭發絲上，輕輕轉動晶石，當轉到某壹方向時出現雙影，即壹根頭發變兩根，效果清晰明顯，這是由天然水晶的晶體排列產生的雙折射現象，假晶做不到。雙影效果越明顯，說明晶體質量越好，有些雜質過多的天然水晶可能雙折不明顯，或出現發絲扭曲、直線變斷線等現象，這樣的晶石質量就差壹些。
7、光學鑒別，玻璃是不結晶的均質體，水晶是結晶的非均質體，在偏光鏡下轉動360度有似明似暗變化的是天然水晶，沒有變化的是假水晶。另外，某些天然水晶如紫晶有二色性，假晶則沒有。
8、內含物觀察，多數合成水晶內部純凈，好大壹塊，看上去十分完美無暇；而天然水晶壹般或多或少總帶有壹些“棉”、裂隙等“瑕疵”。天然品很純凈的不是沒有，但非常稀少，物以稀為貴，體現在價格上，同樣塊度顏色凈度的黃水晶，天然品要遠遠大於合成水晶。