首先，金質紀念幣和金牌最明顯的區別就是有沒有面額。面額是國家法定貨幣的標誌，而黃金紀念幣標有面額，而金牌則沒有，這就說明了它們在性質上的區別:黃金紀念幣是國家的特殊法定貨幣，具有法定地位，具有很強的壟斷性和排他性，而金牌則不具備這壹特點。
其次，在審批程序、鑄造工藝、顏色上也有壹些差異。黃金紀念幣是中國人民銀行發行的，對鑄造工藝和標準顏色要求極高，而黃金紀念章在這些方面比較隨意，質量也比較低劣。
第三，在流通方面，黃金紀念幣按照國家規定發行，鎖定發行量，壹次性向社會公布。金質紀念章的發行量或多或少都是根據市場需要。
另外，從頒發的證書上也可以看出他們的不同。黃金紀念幣必須出具鑒定證書，註明法定貨幣、發行部門、鑄造廠、發行單位、正反面圖案介紹、國名、年號、顏色、面額、金銀含量、中國人民銀行行長簽名等。但有些金質紀念章是有證書頒發的，有些沒有。即使發行證書，其內容也與黃金紀念幣不同。這些差異使得他們的國際聲譽大相徑庭。