枸杞子本品含糖較多，在40%以上，極易吸潮泛油、發黴和蟲蛀；而且其成分的色質也極不穩定，容易變色，是中藥材中較難保養的品種。普通的貯藏方法很難使之妥善保管，達到防潮、防蛀、防悶熱的目的。
貯藏方法：
①乙醇保管法：將枸杞子用乙醇噴霧拌勻，然後用無毒性的塑料袋裝好，排除空氣，封口存放，隨用隨取。此種方法既可防止蟲蛀，又可以使其色澤鮮艷如鮮品。
②塑料袋真空保存法：在塑料袋中放入裝有生石灰的小麻袋，然後將去除雜質的枸杞子放入塑料袋中，烤封塑料袋口，抽出袋內空氣，置陰涼處貯存。應用此法，需隨時檢查，防止漏氣。另外，石灰不可過多，應視枸杞子含水量和其它情況而定。
③冷藏法：將枸杞子藥材置於冰箱或其它的冷藏設備中0~4℃保存，此法是簡單、實用的壹種貯藏方法。
④黴變處理方法：將黴變的枸杞子置於圓簸箕中，雙手將結塊者搓散，棄去嚴重變質者，噴淋適量白酒，濕潤表面白斑處，雙手搓除斑，反復多次，直至無斑。然後用微火焙幹，並常用手輕搓翻動，使之散發水汽，出鍋過篩，然後密封保存。
密封罐是花茶最好的保存器皿，可避免花茶受潮變質。所以，最好的方式就是將花茶放在密封罐中，並將罐口密封好，以免受潮；如果用原來的袋裝，要將空氣擠出，用夾子夾好，保持密封。另外，可以放在保鮮盒中，這樣可以疊起來，方便收藏。
另外壹種保存方法就是避免陽光直射。要將花茶放置於陰涼幹燥的地方，這是因為光線、濕氣與溫度都容易讓花茶變質。若將花茶放在冰箱中，則可以延長保存期限，壹般可存放2年左右。但平時保存的花茶並不需要冷藏於冰箱中，只需用密封的玻璃罐保存即可。