舞臺是日本面臨新時代。人工智能領軍企業“沸點智能”研發的人形AI機器人“人機娃娃”正式開始運營。“人機娃娃”精致到和人類沒有太大區別，很容易融入各行各業。
另壹方面，恐怖組織“死亡之雷。net”，不認同這種好的局面，把人機娃娃嚇得失控，企圖毀滅人類。然而，政府早就察覺到他們的行動，並成立了直屬內閣辦公室的特別情報機構“A.I.M.S”。目的是鎮壓失控的AI機器人，維護公共秩序。
其中，非點即無搞笑天賦卻以搞笑藝人為目標的人，他們活躍的搞笑場地都被AI搶走了。所以受其打擊的人得知，創立“沸點智能”的爺爺也是總裁去世。在他的遺言中，他任命或某人為“沸點情報”的第二任總裁。
對大企業總裁不感興趣的人，有壹個因為“死雷”入侵而失控的人機娃娃。網”。於是，他接受了只有“沸點情報”總裁才能擁有的“沸點零壹司機”，然後變身假面騎士零壹。
作為“沸點智能”的新總裁，他決定投身於對抗AI的戰鬥中。他與“死亡之雷”的糾纏。net”、“A.I.M.S”敵視AI，以及人們圍繞AI的發展和權利的競爭意向。