1941年，北京人的頭骨移交給美國海軍陸戰隊，即將離開北京撤回美國。同年65438年2月5日，日軍乘火車前往秦皇島，但由於珍珠港事件的爆發，日軍在北京、天津等地俘虜了美軍士兵，從此再也沒有找到北京人的頭骨。？北京人頭骨？失蹤後，壹直被外界密切關註。許多人不懈努力尋找它的下落，但它在哪裏仍然是壹個未解之謎。很多猜測讓事情變得更加復雜。
有壹個諺語說化石在戰爭中被破壞了。因為當時化石消失的時候，二戰東方主戰場正在進行壹場激烈的戰鬥。雖然日本人在秦皇島附近捕獲了這塊化石，但它可能在運輸過程中遭到了破壞。另壹種說法是化石可能流入了日本人體內。因為日軍占領北京後，就存放起來了？北京人？協和醫科大學醫院的化石被仔細搜索。這些化石被帶到日本後，極有可能被日本人遺失。
另壹種說法是化石在下沈？阿波丸？在網上找到的？阿波丸？1號是二戰時期的日本油輪。1945年，阿波丸在新加坡裝載了大量從東南亞撤退到日本的日本軍官和達官貴人。該船行駛至中國福建省牛山島以東海域，遭遇正在巡航的美國潛艇？皇後魚？攻擊，3分鐘後迅速沈沒。其實關於化石在哪裏有很多猜測，比如當年的運輸船。哈裏森總統？這些推測大部分都沒有得到證實。在尋找這塊化石的路上，中國科研人員還有很長的路要走。