千佛塔已經損壞很久了。清末，本市愛國詩人黃遵憲為懲戒千佛塔，將塔的殘片收集起來，收藏在人民住宅中，譜寫了千佛塔之歌。從1935開始，梅縣縣長彭景義和黃先生將塔移至東山嶺，建八角亭保護。由於時代變遷，鐵塔被圍在鋼鐵廠內，日益受到汙染和破壞，不便於遊客觀賞，輿論呼籲對其進行保護。
1989年冬，明慧法師應梅州市佛教協會邀請，從韶關雲門寺回到祥子。那壹年，他去了師傅發起的普通塔，幫助弘揚佛法，拓展道場。
1990春節期間，由明慧大師發起，在全體民眾的支持下，選擇蓮花山修建九層花崗巖塔，保護文物。這壹善舉得到了當地政府和社會領導的響應，隨即得到了省文物部門“同意搬遷並自行籌集資金”的批復。
同年7月，由市、縣、區有關領導和大和尚、元徹大師及海內外護法組成了千佛塔籌備委員會。明慧法師坐鎮，積極籌款，走遍世界各地，得到華僑、港澳熱心支持，佛教居士自願前來工作。
2月3日，千佛塔奠基。1993年2月6日，主塔工程封頂，千佛塔鑄造完善，移至石塔底部保護，繼續修建三層塔。