天珠鑒定機構大多在拉薩河成都等地，不過這種鑒定也只能鑒定天珠的材質，而天珠的材質本身是價值不高的，主要是歷史價值和宗教文化的影響比較大。
鑒定天珠要從天珠的質地、色澤、光澤、透明度、完整性、風化紋和朱砂點等方面進行，最早的天然天珠是由海螺化石打磨而成，後來由於化石的稀缺，古西藏人開始采用壹種含玉質及瑪瑙成分的沈積巖打磨天珠，天然形成的規則圖案，以眼球為主，輔以三角形、四邊形等。
天珠的分類
（壹）老天珠
老天珠是數千年前由藏民開采出礦石經過人工研磨而成，其問花紋由喇嘛邊念誦經文邊用特殊工藝繪制、鑲嵌而成，經過開光、加持、供奉後，歷代相傳，成為稀世珍品。
在老天珠的上面，壹般會有朱砂點、彎月形風化紋、不規則形裂紋，圖騰鈣化、白色線紋部分繪制得較為粗糙，並巳有泛黃現象，在陽光下用放大鏡能看到珠體表面有諸多細小的麻坑。
（二）新天珠
新天珠礦石（瑪瑙丿產於海拔平均4000米以上，高寒的喜馬拉雅山脈，根據所開采出的礦石（瑪瑙）顏色及硬度可分為：紅玉髓，原始礦石呈暗紅色，因有壹些礦石內部形成紋理不同，可看到有花紋。
黑玉髓，呈黑色，有經過拋光處理的，表面明亮有光澤，天然紋路瑪瑙，內部條紋黑白相同，形成壹圈壹圈的天然圖案，好像人的眼睛，稱之為＂佛眼”，還有壹些紅白相問，顏色細膩。新天珠的紋繪壹般很細膩，珠體光亮，沒有麻坑。