明代檔案庫不僅遍及全國， 而且規模、 建築技術、管理工作都有相當水平。洪武十四年朱元璋親自籌劃在南京後湖(今玄武湖)的中心小島上建造中國封建社會規模最大的檔案庫──後湖黃冊庫，專藏全國賦役黃冊與魚鱗圖冊。後湖黃冊庫與明代相始終，至明末庫藏黃冊達179 萬余冊之多。明初還在宮內建古今通集庫，收藏皇帝給功臣、將領、藩王、駙馬等的誥封、鐵券和官員的誥封底簿等檔案，由太監掌管，是皇帝的禦用檔案庫。嘉靖十三年(1534)在東苑(今紫禁城外東側)仿古代石室金匱之制，建造了全用磚石砌成的宮殿式的檔案庫──皇史。專藏皇族的玉牒、歷代皇帝的實錄和聖訓。皇史在建築技術上具有適合保存檔案的各種特點，反映了中國古代高超的建築水平和保護檔案技術的知識。明代地方普遍設有黃冊庫、架閣庫、案牘庫，有的庫房建築也有相當規模。如江西布政使黃冊庫，壹次修建庫房50間，廳事 3間。太平府架閣庫，壹次修庫三連各五楹，“左藏黃冊，右藏案牘”，收貯的檔案很多。在庫房建築上，註意“鑿池蓄水”,“布地以沙”,“覆沙以板”，利於防火、防鼠和防潮。