花龜的頭部光滑無鱗，略呈圓錐狀，前端鈍圓，後端略尖；吻端略突出於上喙，向內下傾斜，頭背輪廓線條微斜；眼大小中等，鼻孔橢圓形，位於吻端；背甲較平扁，前端略窄，後端寬，後緣呈清晰鋸齒狀，且向上翹；椎盾5枚，第壹枚五邊形，第二至第四枚六邊形，第五枚五邊形；肋盾4枚，緣盾12枚；臀盾1枚，較小；每塊盾片上均有清晰、密集的同心環紋。腹甲略短於背甲，前緣平切，後緣凹入；甲橋明顯，不可活動；腹盾縫股盾縫喉盾縫肱盾縫胸盾縫肛盾縫喉腹股縫悉數；四肢略扁平，前肢棕灰色，具鮮明大斑點，後肢灰黃色且有棕灰色斑點，前肢5爪，後肢4爪；爪尖細鋒利。
花龜性情溫順，動作緩慢，具有較強的耐饑能力。常棲息於小河塘中，頭尾出頭率高，受驚後即潛入水中，環境安靜時伸出頭、尾和四肢，在水中爬行；環境喧鬧時則藏於龜殼中。喜弱光照射和較大的濕度，平時用肉眼觀看，在水中活動時較難看見。在水中浸泡過久或水質不佳時，腹甲易發白並附著汙物。