故事成功地描繪了原本隱藏在黑暗中，用世界上最強的毅力和最努力去做最隱秘、最殘忍的事情的忍者，作為陽光下最驕傲、最耀眼的職業。
十多年前，壹只可怕的尾獸“九尾狐貍”襲擊了木葉陰村。當時，第四代霍穎以自己的生命為代價，竭力將“九尾之狐”封印在新生的鳴人身上。最後木葉村風平浪靜，但村民們卻視鳴人為怪物，大家都疏遠他。無奈，鳴人試圖用各種惡作劇吸引大家的註意力。在伊魯卡老師的照顧下，鳴人壹直保持著樂觀向上的精神。為了讓更多的人認可自己，他下定決心要做壹個火影！鳴人帶著極大的信心和勇氣開始了訓練，但壹切都比他想象的要困難得多！
鳴人從小就很孤獨。木葉村的村民視他為九尾的化身，視他為怪物。十幾年後，鳴人考上了木葉村的忍者學校，並和佐助、木本櫻交了朋友。佐助是內波氏族的最後壹個後裔。當他還是個孩子的時候，他的哥哥，壹個強大的忍者，殺了他家所有的人，然後投靠了壹直想聚集的蕭組織。佐助從小就發誓要殺死哥哥，為家人報仇。鳴人，他們在忍者學校得到了卡卡西老師的悉心指導，在他的幫助下，他們繼續在成長中迎接壹次又壹次的挑戰！
不久之後，在卡卡西的帶領下，鳴人、佐助、木本櫻走上了修行之路。會有無盡的挑戰等著他們，鳴人等人也在這場生死較量中逐漸成長。