沈周的代表作品多藏於大博物館，故宮博物院藏有精美作品，重要的有《仿董巨山水圖》軸（作於成化九年，公元1473年）、《滄州趣圖》卷、《卒夷圖》、《墨菜圖》（這兩幅原為冊頁，後合裝成卷）、《臥遊圖》等。南京博物院也藏有幾幅沈周精品，其中有《東莊圖》、《牡丹》軸，此畫作於 1506年，當時沈周已81歲。遼寧博物館藏有兩幅沈周的傑作，壹幅是《盆菊幽賞圖》卷，畫面中樹石茅亭，亭中飲酒賞菊者三人，意態優閑，布勢疏朗，景物宜人。另壹幅是《煙江疊嶂圖》卷，作於正德二年（1507年），筆墨之運用，隨心所欲，滿紙煙戀，誠屬沈周82歲晚年傑作。此外，臺灣故宮博物院還藏有壹幅沈周極有名的《廬山高圖》軸。
沈周早年多畫小畫，40歲以後才畫大幅繪畫作品，中年畫法嚴謹，用筆沈著，晚年筆墨豪放，氣勢雄強。 沈周的繪畫，技藝全面，在學習前人的基礎上有自己的創造。沈周的代表作品很多收藏在中國各大博物館，北京故宮博物院收藏重要的作品有：《仿董巨山水圖》軸、《滄州趣圖》卷、《卒夷圖》、《墨菜圖》、《臥遊圖》等。中國南京博物院也收藏有幾幅沈周精品，其中有《東莊圖》、《牡丹》軸。遼寧博物館藏有兩幅沈周的傑作，壹幅是《盆菊幽賞圖》卷，另壹幅是《煙江疊嶂圖》卷，它們創作於明代正德二年（1507年），筆墨的運用隨心所欲，是沈周82歲晚年傑作。